173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5037 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  49.33 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  48.89 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  42.01 
 
 		 177 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  43.92 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  45.74 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  40.65 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  45.07 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  49.29 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  40.27 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  48.28 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  48.28 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  38.75 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  40.94 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  42.59 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  45.52 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  45.52 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  38.51 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  45.52 
 
 		 163 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  48.18 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  43.29 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  42.68 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  43.12 
 
 		 168 aa  127  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  41.33 
 
 		 168 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  39.74 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  39.74 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  39.29 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  38.31 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  41.3 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  43.26 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2015  protein-export protein SecB  39.16 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  42.14 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  36.6 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  40.69 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  43.51 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  42.11 
 
 		 171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  35 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3829  protein translocase subunit secB  40.3 
 
 		 215 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  38.85 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0586  protein translocase subunit secB  39.13 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0841998  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  39.39 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0289  preprotein translocase subunit SecB  34.76 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.346906  normal  0.945579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  38.35 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  35.26 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  34.51 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  35.88 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  34.9 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  37.69 
 
 		 157 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  32.89 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  33.75 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  33.96 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3610  preprotein translocase subunit SecB  36.18 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0359  putative protein-export protein SecB  34.59 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0233  preprotein translocase subunit SecB  31.06 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0931237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  37.9 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  37.9 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  32.24 
 
 		 174 aa  90.5  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  34.81 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  34.88 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  29.45 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  31.68 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  32.1 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  32.1 
 
 		 172 aa  87.8  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  30.28 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0106  preprotein translocase subunit SecB  32.08 
 
 		 167 aa  87.8  6e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.044486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  34.21 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  34.38 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  35.04 
 
 		 148 aa  87.4  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  31.85 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  34.21 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  33.55 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0777  preprotein translocase subunit SecB  29.56 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.652302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  32.28 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  29.46 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  33.94 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  31.78 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  29.86 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  33.58 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  30.72 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  31.03 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  31.03 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  31.03 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 165 aa  84  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  30.08 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  29.53 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  34.97 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  31.43 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  32.67 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  35.66 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  30 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>