More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1577 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  83.96 
 
 
270 aa  444  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  60.71 
 
 
260 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  60.71 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  60.71 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  60.48 
 
 
257 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  61.18 
 
 
260 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  56.57 
 
 
257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  55.24 
 
 
264 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  53.63 
 
 
260 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  54.12 
 
 
260 aa  263  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  54.3 
 
 
261 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  54.55 
 
 
258 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  46.4 
 
 
260 aa  246  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  56.69 
 
 
252 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  47.45 
 
 
275 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  46.09 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  47.2 
 
 
256 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  44.62 
 
 
261 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  48.17 
 
 
256 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  44.22 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  44.89 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  43.2 
 
 
257 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  44 
 
 
257 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  46.15 
 
 
263 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  44.08 
 
 
246 aa  186  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  40.84 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  40.87 
 
 
257 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  45.18 
 
 
258 aa  182  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  42.19 
 
 
270 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  43.06 
 
 
263 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  43.06 
 
 
263 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.46 
 
 
267 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  42.26 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  43.13 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  44.39 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  39.62 
 
 
267 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  38.78 
 
 
269 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  41.63 
 
 
265 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  38.53 
 
 
252 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  40 
 
 
267 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  42.79 
 
 
260 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
250 aa  169  4e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  40.52 
 
 
255 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  41.44 
 
 
249 aa  168  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
251 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  37.75 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  41.13 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  41.13 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  43.06 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  39.52 
 
 
250 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  41.82 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  34.75 
 
 
265 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  34.75 
 
 
266 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  34.75 
 
 
265 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  34.75 
 
 
265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  38.1 
 
 
260 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  38.1 
 
 
260 aa  160  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  43.81 
 
 
264 aa  159  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  38.1 
 
 
256 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  36.59 
 
 
258 aa  158  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  36.14 
 
 
258 aa  158  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  36.25 
 
 
255 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  36.32 
 
 
245 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  36.18 
 
 
269 aa  158  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  38.43 
 
 
258 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  40.09 
 
 
266 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  38.68 
 
 
265 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  40.09 
 
 
260 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 
266 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  38.03 
 
 
265 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  35.46 
 
 
255 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  35.46 
 
 
255 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  35.46 
 
 
255 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
255 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  35.86 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  36.86 
 
 
250 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  35.46 
 
 
255 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35.86 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  39.84 
 
 
258 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  35.06 
 
 
255 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  40.93 
 
 
260 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  37.5 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2543  hypothetical protein  40.52 
 
 
253 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.765012  hitchhiker  0.0000000000000291251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  33.2 
 
 
265 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  36.22 
 
 
259 aa  152  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  33.87 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  32.82 
 
 
265 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  34.68 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  41.59 
 
 
328 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  36.4 
 
 
260 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  38.97 
 
 
260 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  35.81 
 
 
269 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  36.22 
 
 
265 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  36.24 
 
 
263 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  38.79 
 
 
260 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  36.08 
 
 
266 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  37.56 
 
 
234 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>