More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0489 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 303 aa  261  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 305 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1903  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  43.54 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3000  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.54 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3077  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  45.42 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5712  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 300 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.908297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0060  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0059  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2930  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32480  Transcriptional regulator LysR family protein  43.24 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5272  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1505  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5052  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4527  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  41.5 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.16 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0522  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0654  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3099  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0573562 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 297 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 305 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5747  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 304 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.017343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 324 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4855  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0794754  normal  0.116025 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  39.8 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2119  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 297 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0148604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  40.07 
 
 		 301 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38010  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2269  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0134543  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 300 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2289  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  40.14 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1715  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35490  LysR family transcriptional regulator protein  39.12 
 
 		 297 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1976  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748438 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 295 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1541  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2296  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 295 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5722  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 300 aa  215  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1568  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2317  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.342284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1444  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>