More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2273 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
503 aa  1026    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  71.54 
 
 
506 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  71.14 
 
 
507 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
487 aa  425  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
495 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
500 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
492 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 
484 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
504 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
490 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 
494 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
486 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
490 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
489 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
491 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.05 
 
 
495 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
501 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
496 aa  356  5.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
506 aa  355  7.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
491 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
479 aa  353  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
516 aa  352  7e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
510 aa  352  7e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
491 aa  349  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
494 aa  350  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
482 aa  348  9e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
476 aa  347  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
512 aa  348  2e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
479 aa  345  8e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
489 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
491 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
493 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
509 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
492 aa  342  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
495 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
485 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 
501 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
511 aa  335  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
504 aa  334  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
501 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
469 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
504 aa  333  5e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
491 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
480 aa  332  8e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
491 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
488 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
509 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
517 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
503 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
469 aa  326  6e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
466 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
504 aa  325  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
485 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
469 aa  325  2e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
509 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
493 aa  324  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 
498 aa  323  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
506 aa  323  5e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
509 aa  323  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
488 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
494 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
496 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
490 aa  320  3e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
502 aa  319  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
484 aa  319  9e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
492 aa  319  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
499 aa  319  9e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
493 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
501 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
481 aa  318  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
505 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
504 aa  317  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
465 aa  316  6e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
474 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
494 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>