242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2012 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  100 
 
 
310 aa  618  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3027  initiation factor 2B related  46.13 
 
 
320 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2147  initiation factor 2B related  45.39 
 
 
309 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000266151  hitchhiker  0.00589649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.64 
 
 
313 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  33.22 
 
 
292 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3347  initiation factor 2B related protein  31.6 
 
 
283 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1571  initiation factor 2B related protein  31.17 
 
 
283 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.85 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  28.38 
 
 
312 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0623  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.27 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.242304  normal  0.23951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.44 
 
 
333 aa  92  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  36.92 
 
 
345 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.68 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2477  initiation factor 2B related  36.03 
 
 
288 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.385124  normal  0.789729 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.28 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  30.4 
 
 
319 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.54 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.7 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  35.06 
 
 
345 aa  87  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.09 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1041  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.31 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  30.94 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  28.43 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  29.52 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  30.28 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14255  predicted protein  30.43 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.66 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  33.87 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  27.09 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  28 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.81 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.39 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.21 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.74 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  32.88 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  31.66 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.88 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.15 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0978  translation initiation factor 2B subunit I  33.53 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0893546  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0246  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  28 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  30.06 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  30.06 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  33.16 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0921  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.25 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  30.87 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.26 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.2 
 
 
342 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.42 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.24 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.97 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.69 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  29.55 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  32.93 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  28 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1646  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.32 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.4 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.73 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  34.15 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  29.89 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  32.73 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  34.62 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.95 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  33.33 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  33.33 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3179  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.22 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3318  aIF-2BI family translation initiation factor  30.22 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3328  eIF-2B alpha/beta/delta family protein  30.22 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0888  translation initiation factor, aIF-2BI family  31 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.332412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  29.96 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  29.96 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  36.77 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.54 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0365  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.92 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  28.67 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  32.76 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  29.83 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  38.24 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1667  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.85 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000944772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.57 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  36.51 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  36.13 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.57 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  35.67 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.32 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35743  predicted protein  29.77 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  27.66 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  38.46 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  28.9 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0005  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  33.95 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  33.13 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.33 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2279  initiation factor 2B related  26.32 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.14439  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  32.82 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.19 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.25 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.64 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.76 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.16 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.16 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>