160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6261 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
416 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  66.85 
 
 
422 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  64.34 
 
 
523 aa  489  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  60.1 
 
 
416 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  57.86 
 
 
420 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  54.62 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  54.22 
 
 
431 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  49.28 
 
 
434 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  49.28 
 
 
434 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  48.8 
 
 
434 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  51.42 
 
 
444 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  49.28 
 
 
423 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  53.05 
 
 
437 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  54.2 
 
 
413 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  49.04 
 
 
423 aa  381  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  47.96 
 
 
423 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  47.96 
 
 
423 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  48.8 
 
 
423 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  47.96 
 
 
423 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  47.96 
 
 
423 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  47.96 
 
 
423 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  55.59 
 
 
413 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  48.23 
 
 
432 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  52.57 
 
 
427 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  50.68 
 
 
440 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  50.41 
 
 
440 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  52.03 
 
 
412 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  49.87 
 
 
433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  51.49 
 
 
442 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  46.3 
 
 
444 aa  352  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  47.26 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  47.26 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  47.26 
 
 
419 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  46.21 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  45.88 
 
 
447 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  42.67 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  40.51 
 
 
420 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  39.69 
 
 
441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  42.22 
 
 
430 aa  232  9e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  41.95 
 
 
484 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  41.09 
 
 
419 aa  230  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  40.2 
 
 
441 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2530  Dyp-type peroxidase family  37.85 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  37.95 
 
 
428 aa  226  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  38.95 
 
 
416 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25540  Tat-translocated enzyme  37.88 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  36.65 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  39.25 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  36.91 
 
 
437 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0231  Tat-translocated enzyme  37.63 
 
 
449 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2987  Dyp-type peroxidase family  40.3 
 
 
403 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000449703  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  36.04 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1834  Tat-translocated enzyme, Dyp-type peroxidase  35.23 
 
 
435 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231169  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2157  Dyp-type peroxidase family protein  38.48 
 
 
398 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1602  Dyp-type peroxidase  38.22 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1626  Dyp-type peroxidase family protein  38.22 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1572  Dyp-type peroxidase family protein  38.48 
 
 
394 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873877  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3951  Dyp-type peroxidase  36.36 
 
 
436 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116282  normal  0.0479981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3398  Dyp-type peroxidase  38.44 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.528141  normal  0.50105 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  33.57 
 
 
409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  33.57 
 
 
409 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4829  Dyp-type peroxidase family  34.46 
 
 
434 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641078  normal  0.0470559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4209  Dyp-type peroxidase family protein  38.42 
 
 
402 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  39.35 
 
 
404 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  37.5 
 
 
408 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2788  Dyp-type peroxidase family protein  37.37 
 
 
406 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00338158  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5006  Dyp-type peroxidase family  40.43 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19120  Tat-translocated enzyme/Dyp-type peroxidase family  37.33 
 
 
470 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  37.36 
 
 
442 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  37.1 
 
 
401 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2591  Dyp-type peroxidase  35.19 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  34.59 
 
 
479 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11720  Dyp-type peroxidase family  36.55 
 
 
440 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0976142  normal  0.508732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  34.06 
 
 
399 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1171  Dyp-type peroxidase family  33.18 
 
 
413 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.244092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1777  Dyp-type peroxidase family  35.75 
 
 
419 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2163  Dyp-type peroxidase family  30.81 
 
 
435 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804223  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31010  Dyp-type peroxidase family  34.7 
 
 
414 aa  136  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.173938  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3078  dyp-type peroxidase  35.45 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04140  Dyp-type peroxidase family  33.42 
 
 
440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0253494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2002  Dyp-type peroxidase family protein  32.98 
 
 
381 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3387  putative iron-dependent peroxidase  34.88 
 
 
124 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5342  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 
473 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.607776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  25.43 
 
 
316 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  24.05 
 
 
352 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  24.55 
 
 
360 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  25.43 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  27.88 
 
 
481 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  25.52 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  26.39 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  33.59 
 
 
1486 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  25.09 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  25.78 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  25.78 
 
 
359 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  25.78 
 
 
359 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  25.78 
 
 
356 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4533  dyp-type peroxidase family protein  27.59 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253706  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  25.26 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  24.24 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10814  hypothetical protein  24.66 
 
 
335 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>