More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5606 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 263 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  67.95 
 
 		 260 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  68.34 
 
 		 261 aa  361  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  68.6 
 
 		 261 aa  357  9e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  68.46 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  67.32 
 
 		 265 aa  351  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  64.73 
 
 		 258 aa  344  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  67.86 
 
 		 687 aa  344  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  64.62 
 
 		 261 aa  343  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  68.85 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  68.85 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  68.85 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  68.08 
 
 		 261 aa  341  7e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  64.03 
 
 		 270 aa  339  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  67.69 
 
 		 261 aa  338  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000235283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  63.46 
 
 		 260 aa  334  9e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  65.34 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  63.46 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  63.85 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  61.22 
 
 		 262 aa  331  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  64.68 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  63.53 
 
 		 260 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  63.89 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  61.34 
 
 		 287 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  60.38 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  63.95 
 
 		 264 aa  325  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  63.22 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  60.94 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  64.45 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  59.77 
 
 		 265 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  60.85 
 
 		 263 aa  308  8e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  61.15 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 		 261 aa  305  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  64.45 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  61.66 
 
 		 308 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  58.43 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  51.95 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  56.92 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  53.15 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.81 
 
 		 248 aa  244  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  51.22 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 250 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  47.6 
 
 		 256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 		 256 aa  232  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 		 254 aa  229  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  53.15 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 650 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.64 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  49.03 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  52.38 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  49.42 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 646 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  48.78 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  49.22 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.81 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 		 254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  46.9 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0851  triosephosphate isomerase  48.41 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  45.08 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 		 251 aa  215  7e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  44.07 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  44.7 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  51.79 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  48.85 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>