245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4639 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4639  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
150 aa  308  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0713771  normal  0.0185757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7127  hypothetical protein  58.67 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  62.09 
 
 
151 aa  169  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  53.64 
 
 
152 aa  153  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.33 
 
 
152 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3016  alkylhydroperoxidase  52.9 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.66 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.32 
 
 
158 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.7 
 
 
152 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.97 
 
 
150 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2040  alkylhydroperoxidase  47.65 
 
 
168 aa  114  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.1 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
144 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3513  alkylhydroperoxidase AhpD  41.61 
 
 
167 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.24 
 
 
163 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.63 
 
 
150 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.8 
 
 
157 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  48.7 
 
 
157 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.62 
 
 
145 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.09 
 
 
158 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  44.88 
 
 
152 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  44.22 
 
 
154 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.6 
 
 
145 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
145 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.85 
 
 
145 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.93 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  37.58 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.41 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.73 
 
 
157 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.93 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  36.96 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  39.46 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  40.5 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.15 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.91 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  36.23 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  34.59 
 
 
145 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.68 
 
 
145 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 
152 aa  94  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  37.68 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 
150 aa  93.6  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.96 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  36.96 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.75 
 
 
166 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.24 
 
 
145 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.14 
 
 
155 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  36.23 
 
 
153 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.16 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.69 
 
 
146 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  34.4 
 
 
159 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.03 
 
 
146 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.73 
 
 
163 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  31.65 
 
 
147 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.98 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.42 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.73 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.94 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.94 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.55 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.73 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  35.51 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  36.72 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.21 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  34.93 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.61 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  39.55 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.1 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 
150 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 
153 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  37.4 
 
 
157 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.57 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  29.93 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.14 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  36.44 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  34.01 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  33.33 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  39.83 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  39.13 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  41.82 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  36.61 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  35.16 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  35.16 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>