More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3765 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3765  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 337 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  45.62 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0926  extracellular solute-binding protein family 3  45.03 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00101537  normal  0.0381381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4344  extracellular solute-binding protein family 3  42.73 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2931  extracellular solute-binding protein  47.04 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0388  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.34 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  0.56756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3684  extracellular solute-binding protein family 3  39.45 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2089  extracellular solute-binding protein  42.35 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4191  extracellular solute-binding protein  40.53 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5512  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.913196  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5876  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.266759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5565  extracellular solute-binding protein family 3  37.99 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  39.86 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6385  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2491  extracellular solute-binding protein family 3  40.78 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2151  extracellular solute-binding protein family 3  40.07 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0107  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.79 
 
 		 313 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4350  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.771986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2085  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 		 295 aa  169  9e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0560  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1888  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2269  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0485236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1691  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.401745  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0740  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2408  cystine-binding periplasmic protein FliY  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1680  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.18 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2150  extracellular solute-binding protein family 3  38.3 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0525  extracellular solute-binding protein family 3  38.3 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34650  amino acid-binding protein  37.82 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  39.86 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0524  extracellular solute-binding protein family 3  40.39 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2490  extracellular solute-binding protein family 3  39.7 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3860  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3901  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3008  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.33 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0407  extracellular solute-binding protein family 3  39.63 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1534  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.12 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.12119 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4320  extracellular solute-binding protein  38.26 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5877  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280922  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4428  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3938  extracellular solute-binding protein  37.12 
 
 		 317 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.138287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2889  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00285086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2504  ABC transporter substrate-binding protein  37.13 
 
 		 313 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02250  amino acid-binding protein  38.52 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.856046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1919  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.659618  hitchhiker  0.00000571338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2412  extracellular solute-binding protein  38.95 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3708  extracellular solute-binding protein family 3  34.54 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5566  extracellular solute-binding protein family 3  38.67 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5873  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0885292 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1701  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4349  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1686  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.72 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1687  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.72 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0397  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.09 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1894  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.72 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3934  twin-arginine translocation pathway signal  37.31 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0254446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0566  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.72 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2401  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.72 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22921  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4432  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.299599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1530  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.31 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4324  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 313 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2264  cystine-binding periplasmic protein FliY  34.72 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0734  cystine-binding periplasmic protein FliY  34.72 
 
 		 406 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4187  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3864  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384517  normal  0.625543 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  37.54 
 
 		 734 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  29.61 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3769  extracellular solute-binding protein family 3  32.12 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  30.66 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 		 302 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  28.78 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1986  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5223  extracellular solute-binding protein family 3  27.4 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170331 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5408  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  28.11 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.38 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  27.11 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  29.05 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  27.51 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27190  amino acid-binding protein  27.92 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  36.26 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1224  extracellular solute-binding protein family 3  28.68 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.324397  decreased coverage  0.00201805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  25.58 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3686  extracellular solute-binding protein family 3  25.9 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  27.9 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.29 
 
 		 296 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.12 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.12 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  33.71 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  33.71 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  33.71 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>