More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3491 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 349 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  66.76 
 
 		 350 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  47.66 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 331 aa  268  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  46.63 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  45.95 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  46.63 
 
 		 340 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  46.26 
 
 		 344 aa  259  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  46.96 
 
 		 348 aa  258  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.38 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  50.15 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  46.67 
 
 		 473 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  45.69 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  46.04 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  45.32 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  48.56 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  46.49 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  47.91 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  44.9 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  46.33 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.16 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  44.98 
 
 		 351 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  40.11 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  44.31 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  45.35 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  43.11 
 
 		 350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  40.79 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  42.98 
 
 		 345 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  42.61 
 
 		 359 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  41.6 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  40.34 
 
 		 343 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  43.86 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  40.94 
 
 		 342 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  41.47 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  42.06 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.71 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 328 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.07 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.38 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.53 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.36 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.26 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  33.24 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.28 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  31.38 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.81 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34.96 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  30.29 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  31.87 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  33.71 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.03 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  31.91 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 323 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 348 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 342 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.55 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.01 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  31.85 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  36.49 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  34.12 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.12 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.25 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.25 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  31.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  31.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.87 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.95 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  31.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  31.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  31.55 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.69 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.2 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  31.53 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>