292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2396 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
130 aa  259  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22780  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  51.67 
 
 
123 aa  130  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0718259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  48.89 
 
 
110 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  41.88 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  44.09 
 
 
109 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
148 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.5 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.44 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.26 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.62 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.28 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.45 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  35.65 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.44 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.55 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.05 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.59 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  42.02 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
295 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0170  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.65 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.45 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  43.16 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  45.26 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7078  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.74 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0342158  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  45.26 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  44.21 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  37.93 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  40.96 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  36.56 
 
 
380 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.29 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.36 
 
 
299 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 
108 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  38.3 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  33.75 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.63 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5940  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  38.18 
 
 
259 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2661  carboxymuconolactone decarboxylase  34.43 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.74 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4207  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.38 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4019  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.74 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000710611  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3905  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.74 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00819268  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.56 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  31.07 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.41 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  31.07 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  31.07 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.26 
 
 
250 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.11 
 
 
398 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3726  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.99 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 
248 aa  61.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1216  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.7 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0658576  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0832  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.65 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190386  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3492  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.05 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196165  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2260  carboxymuconolactone decarboxylase  31.73 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0448  carboxymuconolactone decarboxylase  40.7 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  36.13 
 
 
391 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2687  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.47 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.22317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
393 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.65 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 
238 aa  60.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.26 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4700  carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3662  carboxymuconolactone decarboxylase  33.88 
 
 
155 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.318309  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1901  carboxymuconolactone decarboxylase  35.79 
 
 
129 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0381  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.7 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.07667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.55 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>