More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1386 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1386  short chain dehydrogenase  100 
 
 
256 aa  500  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  60.08 
 
 
252 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.77 
 
 
261 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.1 
 
 
267 aa  275  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5265  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 
265 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 
244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1491  short chain dehydrogenase  55.41 
 
 
233 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1462  short chain dehydrogenase  55.65 
 
 
259 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780505  normal  0.472933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  51.55 
 
 
262 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13582  short chain dehydrogenase  55.34 
 
 
259 aa  244  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2137  short chain dehydrogenase  51.57 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.422468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
257 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2830  short chain dehydrogenase  52.87 
 
 
247 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2633  short chain dehydrogenase  53.2 
 
 
252 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522404  normal  0.186354 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  51.63 
 
 
254 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2066  short chain dehydrogenase  49.6 
 
 
251 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3623  short chain dehydrogenase  52.19 
 
 
280 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8757  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215149  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 
295 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
266 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.818797  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
265 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.87 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.04 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101866  normal  0.0165193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
262 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
251 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
252 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
244 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16710  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
250 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
258 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.951594  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
256 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  36.4 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
266 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
255 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.39 
 
 
249 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
248 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
258 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
250 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
257 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.15 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
263 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
272 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
266 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
251 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
260 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
269 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
258 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2236  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
266 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0079693  hitchhiker  0.0000000000146791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
263 aa  122  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.65 
 
 
248 aa  121  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 
278 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.15 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0400  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.52 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0215607  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.69 
 
 
255 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000027021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  33.2 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
257 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
247 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
261 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
253 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  36.8 
 
 
261 aa  119  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  32.93 
 
 
258 aa  118  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0623  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  36.22 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0407  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.3 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.436635  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.66 
 
 
251 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
254 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2879  putative alcohol dehydrogenase, zinc-independent  34.73 
 
 
265 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.575303  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
261 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  32.82 
 
 
265 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>