242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4005 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4005  carboxymethylenebutenolidase family protein  100 
 
 		 245 aa  517  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0806  dienelactone hydrolase  70.49 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3217  dienelactone hydrolase  70.49 
 
 		 245 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3320  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2467  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3435  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 245 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3507  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3630  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0857  dienelactone hydrolase  68.03 
 
 		 245 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0903  dienelactone hydrolase  68.44 
 
 		 245 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.833449  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0788  dienelactone hydrolase  67.21 
 
 		 245 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.237009  normal  0.0587871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3046  dienelactone hydrolase  70.08 
 
 		 245 aa  360  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.715018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0826  dienelactone hydrolase  66.8 
 
 		 245 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.390994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0743  dienelactone hydrolase  67.62 
 
 		 245 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.774494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1546  dienelactone hydrolase  65.31 
 
 		 245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.770426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0519  dienelactone hydrolase  66.8 
 
 		 245 aa  350  2e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0924  dienelactone hydrolase  64.75 
 
 		 245 aa  347  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1544  threonyl-tRNA synthetase, class IIA  63.67 
 
 		 245 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0613  dienelactone hydrolase  66.38 
 
 		 244 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  61.07 
 
 		 244 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0967  dienelactone hydrolase family protein  74.85 
 
 		 172 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3109  Carboxymethylenebutenolidase  54.29 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  40.5 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1279  Carboxymethylenebutenolidase  40.65 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3192  Carboxymethylenebutenolidase  44.05 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78962  carboxymethylenebutenolidase  41.67 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0108419 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2927  dienelactone hydrolase  44.05 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10652  dienelactone hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G07130)  44.4 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0533  dienelactone hydrolase  38.21 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0392  carboxymethylenebutenolidase  37.19 
 
 		 250 aa  184  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06410  carboxymethylenebutenolidase, putative  37.02 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  27.76 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  26.69 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0964  hypothetical protein  59.7 
 
 		 68 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.27 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  30.33 
 
 		 420 aa  89.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.61 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  26.07 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  26.1 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  27.39 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  26.64 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  28.76 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 		 409 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  27.62 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  29.06 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  26.96 
 
 		 407 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  28.45 
 
 		 413 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  28.23 
 
 		 409 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  27.73 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  25.22 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  28.88 
 
 		 295 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  25.1 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  26.05 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  29.22 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  26.56 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  32.62 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  25.63 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 		 411 aa  68.9  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  21.81 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  25.37 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  28.8 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4124  dienelactone hydrolase  26.1 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  26.14 
 
 		 415 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  26.89 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  25.21 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  26.47 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  26 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  28.81 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  26.81 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  27.95 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  29.31 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  28.33 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  24.17 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.75 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  25.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37970  Dienelactone hydrolase-like protein  26.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  25.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  25.32 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3874  dienelactone hydrolase  26.29 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0470688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  25.85 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  27.12 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>