83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3430 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 397 aa  806    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  32.59 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  30.4 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.75 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  34.48 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  33.86 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  33.23 
 
 		 342 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  31.09 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  30.47 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  28.85 
 
 		 365 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.08 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  30.06 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.84 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  26.77 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.27 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  27.22 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.34 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  27.2 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.32 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  25.97 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  31.51 
 
 		 323 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.75 
 
 		 359 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  25.77 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 337 aa  96.3  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  24.57 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.52 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  27.51 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 336 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 338 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 338 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.69 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  23.77 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  24.61 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.67 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.96 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.96 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.79 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.07 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  25.52 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.54 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.08 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  25.72 
 
 		 661 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  24.78 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.89 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.89 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.89 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.89 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  22.62 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.83 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  24.63 
 
 		 335 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.65 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.82 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.72 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  30.37 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  31.76 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.85 
 
 		 313 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  27.32 
 
 		 794 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  23.66 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.26 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  31.18 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  23.17 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  24.62 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1546  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.94 
 
 		 652 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  25.41 
 
 		 714 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  32.29 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 2082 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  22.26 
 
 		 931 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>