74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3323 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3323  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.283862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4390  hypothetical protein  74 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  73.33 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51300  hypothetical protein  75.51 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000068395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  60.38 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3187  putative permease  79.07 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  66.07 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3956  membrane protein, PerM family  75.56 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1545  hypothetical protein  75.56 
 
 		 356 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0842476  normal  0.0322858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  69.57 
 
 		 353 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0259  protein of unknown function UPF0118  65.96 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  67.92 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1368  hypothetical protein  75.56 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  66.67 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  69.57 
 
 		 360 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1660  hypothetical protein  73.47 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  76.09 
 
 		 356 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4184  hypothetical protein  71.11 
 
 		 356 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  72.92 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  68.75 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0190  hypothetical protein  64.15 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1264  hypothetical protein  71.11 
 
 		 356 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.833636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3978  hypothetical protein  71.11 
 
 		 356 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1234  hypothetical protein  71.11 
 
 		 356 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.946074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  71.7 
 
 		 357 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  72.73 
 
 		 356 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  72.73 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  72.73 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  72.73 
 
 		 354 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  65.38 
 
 		 359 aa  70.9  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  71.74 
 
 		 355 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  66.67 
 
 		 353 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1693  hypothetical protein  70.21 
 
 		 358 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.561325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  68.89 
 
 		 372 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1649  hypothetical protein  60.78 
 
 		 360 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.673436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  69.77 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  66.67 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  66.67 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  66.67 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2171  hypothetical protein  63.27 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.655201  normal  0.719413 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  66.67 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  66.67 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2435  hypothetical protein  69.57 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  62.26 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0764  hypothetical protein  66 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0660  riboflavin transporter  66 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721a  permease  61.54 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  64.58 
 
 		 366 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  64.58 
 
 		 366 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  64.58 
 
 		 366 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2481  hypothetical protein  67.35 
 
 		 356 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.691389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2574  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  63.04 
 
 		 356 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  66.67 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  66.67 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1829  hypothetical protein  66.67 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.2453  normal  0.256539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1697  hypothetical protein  66.67 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.588209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  66.67 
 
 		 360 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  58.49 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0826  permease protein PerM, truncation  59.62 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  53.85 
 
 		 365 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  69.05 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2867  permease PerM, putative  61.22 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  65.85 
 
 		 354 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1408  hypothetical protein  65.91 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.285024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3470  hypothetical protein  47.62 
 
 		 362 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0662  permease, putative  76.6 
 
 		 362 aa  41.2  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>