More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1954 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1954  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 400 aa  823    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1687  tryptophan synthase, beta subunit  69.21 
 
 		 403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1989  tryptophan synthase subunit beta  66.25 
 
 		 400 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0603681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0742  tryptophan synthase subunit beta  67 
 
 		 403 aa  566  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.782615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1358  tryptophan synthase, beta subunit  67.85 
 
 		 399 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.33574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1513  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 401 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0165  tryptophan synthase subunit beta  67.25 
 
 		 401 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522079  normal  0.230942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3216  tryptophan synthase subunit beta  65 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1700  tryptophan synthase subunit beta  64.57 
 
 		 407 aa  547  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.605674  hitchhiker  0.0000000413571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2965  tryptophan synthase subunit beta  66.08 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.204496  normal  0.0390999 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001499  tryptophan synthase beta chain like protein  66.33 
 
 		 407 aa  541  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3688  tryptophan synthase subunit beta  64.14 
 
 		 400 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00755497  normal  0.13811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1244  tryptophan synthase subunit beta  65.64 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1800  tryptophan synthase subunit beta  62.37 
 
 		 402 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.755305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0198  tryptophan synthase subunit beta  63.43 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2001  tryptophan synthase subunit beta  62.76 
 
 		 393 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.642175  normal  0.209824 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1460  tryptophan synthase subunit beta  63.99 
 
 		 406 aa  513  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184995  normal  0.0669492 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52286  tryptophan synthase, beta chain  58.29 
 
 		 385 aa  475  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  54.57 
 
 		 418 aa  464  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0551  tryptophan synthase subunit beta  60.15 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0798  tryptophan synthase subunit beta  55.99 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  55.81 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2306  tryptophan synthase subunit beta  54.99 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  53.67 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  54.71 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  53.71 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  54.06 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  53.16 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  52.91 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  53.45 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  53.96 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  55.3 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  54.22 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  53.18 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  53.51 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  52.38 
 
 		 403 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0583  tryptophan synthase subunit beta  53.21 
 
 		 403 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6842  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.726467  normal  0.411948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  53.32 
 
 		 400 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 397 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  55.03 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  53.2 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  55.22 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  51.9 
 
 		 401 aa  435  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0972  tryptophan synthase subunit beta  55.47 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  50 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  54.45 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  52.81 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  51.91 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  52.43 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1686  tryptophan synthase subunit beta  54.74 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.815496  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  54.86 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5243  tryptophan synthase subunit beta  51.52 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  52.94 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2592  tryptophan synthase subunit beta  52.14 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  52.31 
 
 		 397 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  55.18 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  51.39 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3616  tryptophan synthase subunit beta  52.17 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.356253  normal  0.8802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3050  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3066  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.910366  normal  0.238699 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0101  tryptophan synthase, beta subunit  54.15 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0446172  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2220  tryptophan synthase subunit beta  49.76 
 
 		 431 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  52.82 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  54.86 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3109  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1487  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0870  tryptophan synthase subunit beta  52.42 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318108 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  52.44 
 
 		 399 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  53.85 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 414 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1415  tryptophan synthase subunit beta  51.71 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1277  tryptophan synthase subunit beta  52.7 
 
 		 399 aa  428  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  52.69 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  51.15 
 
 		 399 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1215  tryptophan synthase subunit beta  50.63 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3239  tryptophan synthase subunit beta  52.14 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1788  tryptophan synthase subunit beta  51.65 
 
 		 435 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  54.86 
 
 		 393 aa  428  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  50.51 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>