More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1238 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  239  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  46.49 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  43.16 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.3 
 
 		 480 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.65 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.11 
 
 		 388 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.84 
 
 		 380 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.24 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.3 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  29.51 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  35.96 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  41.77 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 323 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  31.3 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  26.32 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.33 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  27.83 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  25.83 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  29.25 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  30.86 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.78 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.67 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.28 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.91 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  29.31 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.83 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  25.86 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 533 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.12 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 529 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 528 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.31 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  34.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  32.04 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  27.68 
 
 		 551 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.11 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  33.73 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  28.89 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.25 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  23.97 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  30.49 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 529 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.71 
 
 		 393 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  30.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  33.66 
 
 		 460 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.56 
 
 		 392 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 466 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  31.87 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 467 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  23.21 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  32.1 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  25.25 
 
 		 119 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  34.41 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.18 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  26.97 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.58 
 
 		 386 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.07 
 
 		 390 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>