297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0228 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 222 aa  460  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  45.71 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  42.34 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  42.99 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  42.99 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  42.99 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  42.53 
 
 		 210 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  42.06 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  42.06 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  41.82 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  41.59 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  40.53 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  40.35 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  38.84 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  43.33 
 
 		 211 aa  158  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  44.26 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  45.6 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  37.28 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  41.57 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  36.9 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  39.75 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  35.33 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  38.41 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  34.03 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  32.71 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  33.51 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  32.71 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.17 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  32.66 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  31.98 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  35 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  37.58 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  36.94 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  27.88 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 		 192 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  32.97 
 
 		 216 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  34.71 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  37.32 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  34.24 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  34.42 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  33.93 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  35.63 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  34.69 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  31.45 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 		 197 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  32.72 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  31.68 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  27.42 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  31.76 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  32.08 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  34.16 
 
 		 231 aa  92  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  36.09 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1776  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254998  normal  0.31988 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  30.68 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.57 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  30.86 
 
 		 197 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  35.17 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  28.57 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  31.28 
 
 		 208 aa  90.1  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  33.81 
 
 		 197 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  32.12 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  35.33 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  30.23 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  32.11 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  30.96 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 		 197 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  25.84 
 
 		 291 aa  86.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  27.8 
 
 		 256 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.92 
 
 		 191 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  33.92 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>