More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05140 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05140  conserved hypothetical protein  100 
 
 
704 aa  1436    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  41.54 
 
 
666 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29166  CBS domain-containing protein  37.72 
 
 
609 aa  357  5.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13833  predicted protein  31.55 
 
 
443 aa  183  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  39 
 
 
146 aa  78.2  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 
144 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 
155 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  46.84 
 
 
145 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 
144 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  40.78 
 
 
140 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  37.04 
 
 
144 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
148 aa  68.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  34.67 
 
 
140 aa  67  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  34.26 
 
 
147 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  33.85 
 
 
148 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  43.64 
 
 
120 aa  65.5  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  37.61 
 
 
125 aa  65.1  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  29.23 
 
 
146 aa  64.7  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  32.69 
 
 
120 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31.3 
 
 
142 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 
140 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4731  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 
145 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  34.91 
 
 
138 aa  61.6  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1584  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.14 
 
 
606 aa  62  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.55 
 
 
140 aa  61.6  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  36.89 
 
 
615 aa  61.2  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  34.19 
 
 
148 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  30.95 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  29.24 
 
 
618 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  32.65 
 
 
149 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
185 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
140 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 
149 aa  60.1  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  32.17 
 
 
149 aa  60.1  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  32.35 
 
 
139 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  27.03 
 
 
150 aa  60.1  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  39.53 
 
 
145 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  33.6 
 
 
603 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  36.46 
 
 
139 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1344 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
615 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  37.25 
 
 
131 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
873 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  36.67 
 
 
144 aa  57.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 
624 aa  57.4  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000925  Signal transduction protein  31.01 
 
 
622 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.334534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  35.59 
 
 
615 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  38.1 
 
 
148 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2269  magnesium transporter  32.5 
 
 
454 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0532952  hitchhiker  0.0000374811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  34.75 
 
 
615 aa  57.4  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  32 
 
 
614 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 
606 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  25 
 
 
182 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  32.28 
 
 
615 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3740  KpsF/GutQ family protein  36.26 
 
 
391 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
147 aa  55.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 
145 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  33.61 
 
 
164 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  27.5 
 
 
141 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  38.78 
 
 
158 aa  55.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4909  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.07 
 
 
517 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.636899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  38.82 
 
 
325 aa  55.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  28.1 
 
 
143 aa  55.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
156 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13445  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.77 
 
 
529 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0612971  normal  0.0362546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  30.56 
 
 
146 aa  54.3  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  39.24 
 
 
139 aa  54.3  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.82 
 
 
145 aa  54.3  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  21.98 
 
 
348 aa  54.3  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.9 
 
 
615 aa  54.3  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  31.62 
 
 
146 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  30.17 
 
 
140 aa  54.3  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  33.06 
 
 
150 aa  53.9  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4954  CBS domain-containing protein  30 
 
 
624 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  31.65 
 
 
615 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  34.29 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  31.65 
 
 
615 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  34.29 
 
 
606 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.71 
 
 
142 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.45 
 
 
482 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  33.65 
 
 
139 aa  53.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.78 
 
 
141 aa  53.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
144 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  32.38 
 
 
145 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  34.19 
 
 
139 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1072  CBS domain containing protein  28.72 
 
 
221 aa  53.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  31.03 
 
 
144 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 
154 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  33.64 
 
 
142 aa  52.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
615 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  31.03 
 
 
144 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  34.62 
 
 
325 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1428 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  35.58 
 
 
620 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1184  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.37 
 
 
517 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>