More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01240 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK01240  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  996    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0075  peptide chain release factor 1  44.11 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.439429  normal  0.176298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0470  peptide chain release factor 1  43.64 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.807242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  45.79 
 
 		 361 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0377  peptide chain release factor 1  42.98 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.117375  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0097  peptide chain release factor 1  43.67 
 
 		 361 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.208503 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  41.31 
 
 		 356 aa  249  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  41.3 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  41.54 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  42.07 
 
 		 366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58482  predicted protein  39.01 
 
 		 376 aa  246  6.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.901315  normal  0.257892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  40.71 
 
 		 363 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7604  peptide chain release factor 1  44.55 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  42.25 
 
 		 360 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0780  peptide chain release factor 1  43.25 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  40.43 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  44.24 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  40.18 
 
 		 362 aa  242  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  43.04 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 370 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  40.71 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  40.51 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5476  peptide chain release factor 1  42.64 
 
 		 360 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0851  peptide chain release factor 1  42.94 
 
 		 367 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1582  peptide chain release factor 1  39.39 
 
 		 357 aa  240  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  39.82 
 
 		 361 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  44.24 
 
 		 360 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0850  peptide chain release factor 1  48.33 
 
 		 373 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  39.73 
 
 		 370 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0775  peptide chain release factor 1  40.36 
 
 		 373 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  41.52 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  40.42 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0918  peptide chain release factor 1  46.56 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0955  peptide chain release factor 1  46.56 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal  0.0330786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  40.72 
 
 		 360 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  39.76 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  43.77 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  41.46 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  42.25 
 
 		 356 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  39.47 
 
 		 370 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3664  peptide chain release factor 1  42.64 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  42.64 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1564  peptide chain release factor 1  42.73 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  40.6 
 
 		 359 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  37.27 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  39.82 
 
 		 360 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0889  peptide chain release factor 1  45.42 
 
 		 358 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.491137  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0112  peptide chain release factor 1  41.49 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  38.72 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  38.4 
 
 		 355 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  39.49 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  41.91 
 
 		 358 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  40.12 
 
 		 360 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  39.88 
 
 		 355 aa  234  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  40.66 
 
 		 355 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4748  peptide chain release factor 1  40.9 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0340  peptide chain release factor 1  41.27 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  41.54 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  39.22 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  39.52 
 
 		 360 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4206  peptide chain release factor 1  42.04 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3498  peptide chain release factor 1  40.71 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3169  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0797  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0297796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  39.52 
 
 		 360 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  40.26 
 
 		 361 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  38.61 
 
 		 360 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0801  peptide chain release factor 1  39.4 
 
 		 363 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00710906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  40.48 
 
 		 360 aa  233  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  36.46 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  39.51 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  40.53 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  40.3 
 
 		 359 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  40.42 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  39.61 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  38.25 
 
 		 363 aa  232  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  42.24 
 
 		 357 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  39.64 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1411  peptide chain release factor 1  39.94 
 
 		 362 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.768001  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0894  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0769  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.081149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0292  peptide chain release factor 1  41.8 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.694941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  40.41 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3955  peptide chain release factor 1  40.6 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  40.41 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  40.41 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  39.94 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  41.91 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3833  peptide chain release factor 1  40.45 
 
 		 363 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0994  peptide chain release factor 1  39.77 
 
 		 363 aa  231  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3178  peptide chain release factor 1  39.95 
 
 		 361 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000107568  normal  0.412764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  41.64 
 
 		 361 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  41.67 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  42.38 
 
 		 351 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  40.12 
 
 		 360 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 363 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  39.52 
 
 		 361 aa  230  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>