47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02440 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02440  peptide transporter, putative  100 
 
 		 632 aa  1295    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369095  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41479  predicted protein  44.19 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36233  proton-dependent oligopeptide transporter, POT family  44.57 
 
 		 637 aa  423  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20752  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08915  hypothetical peptide transporter (Eurofung)  39.14 
 
 		 606 aa  409  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42802  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08903  MFS peptide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02550)  34.89 
 
 		 628 aa  346  8.999999999999999e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03408  MFS peptide transporter Ptr2, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01490)  33.46 
 
 		 587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01073  MFS peptide transporter, putaitve (AFU_orthologue; AFUA_1G12240)  32.77 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70645  predicted protein  31 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0413957  normal  0.317652 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66905  predicted protein  31.93 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.705777 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1598  amino acid/peptide transporter  24.07 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0405  amino acid/peptide transporter  22.77 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0035417  hitchhiker  0.00401498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4136  amino acid/peptide transporter  25.54 
 
 		 456 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4162  amino acid/peptide transporter  24.88 
 
 		 456 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790543  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4020  amino acid/peptide transporter  24.04 
 
 		 456 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47218  predicted protein  23.29 
 
 		 619 aa  93.6  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0002  proton/peptide symporter family protein  21.01 
 
 		 516 aa  87.8  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3938  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.21 
 
 		 515 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000127118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3969  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  20.82 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1274  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  22.49 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2147  proton-dependent oligopeptide transporter family protein  23.75 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4030  amino acid/peptide transporter  21.01 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.052619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2667  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  22.43 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.63918  normal  0.181856 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0004  TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.32 
 
 		 515 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000099426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1524  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  21.85 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.868386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1599  oligopeptide transporter  20.43 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.941268  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2411  proton/peptide symporter family protein  20.64 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0404  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  22.2 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117264  hitchhiker  0.000442814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1248  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  21.77 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0301309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4137  amino acid/peptide transporter  20.56 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.728655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4021  amino acid/peptide transporter  24.19 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.925576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4163  amino acid/peptide transporter  24.73 
 
 		 437 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.65473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  25.33 
 
 		 491 aa  50.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1438  TGF-beta receptor type I/II extracellular region  26.83 
 
 		 683 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  26.52 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  26.06 
 
 		 501 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00673  oligopeptide transporter  24.02 
 
 		 284 aa  47.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  22.01 
 
 		 489 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  20.96 
 
 		 490 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  20.75 
 
 		 489 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  20.75 
 
 		 489 aa  47.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3773  amino acid/peptide transporter  31.48 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  28.57 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50811  POT family transporter: dipeptide/tripeptide:proton  24.39 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.030888 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47148  predicted protein  21.88 
 
 		 775 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  23.35 
 
 		 490 aa  44.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  24.23 
 
 		 489 aa  43.9  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  22.55 
 
 		 558 aa  43.9  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>