53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01190 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND01190  flap endonuclease, putative  100 
 
 		 453 aa  923    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33791  predicted protein  49.88 
 
 		 381 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.280438 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02764  5' to 3' exonuclease, 5' flap endonuclease (Eurofung)  70.45 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48638  predicted protein  45.39 
 
 		 421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42373  predicted protein  51.89 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0490  flap structure-specific endonuclease  41.45 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2117  flap endonuclease-1  43.59 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2348  flap endonuclease-1  43.59 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0196172 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0040  flap endonuclease-1  41.45 
 
 		 350 aa  207  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0681  flap endonuclease-1  42.86 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.387412 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1158  flap structure-specific endonuclease  40.73 
 
 		 351 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1985  flap endonuclease-1  41.03 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1913  flap endonuclease-1  39.68 
 
 		 338 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0057  flap endonuclease-1  43.98 
 
 		 333 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0302  flap endonuclease-1  42.68 
 
 		 346 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1212  flap endonuclease-1  39.02 
 
 		 338 aa  183  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1492  flap endonuclease-1  38.43 
 
 		 326 aa  181  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.36701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1634  flap endonuclease-1  39.33 
 
 		 336 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2106  flap endonuclease-1  40.91 
 
 		 333 aa  177  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1926  flap endonuclease-1  40.61 
 
 		 333 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1360  flap endonuclease-1  36.21 
 
 		 324 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.880498  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2521  flap endonuclease-1  40.44 
 
 		 333 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.239531  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0280  flap endonuclease-1  36.01 
 
 		 324 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.969351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0558  flap endonuclease-1  35.66 
 
 		 324 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0703  flap endonuclease-1  36.4 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0356  flap endonuclease-1  35.23 
 
 		 333 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0623  flap endonuclease-1  35.61 
 
 		 324 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0212  flap endonuclease-1  42.65 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.022826  decreased coverage  0.0048464 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0426  flap endonuclease-1  35.14 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1613  flap endonuclease-1  36.4 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2512  flap endonuclease-1  32.18 
 
 		 326 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1081  flap structure-specific endonuclease  34.82 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3231  flap structure-specific endonuclease  34.27 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.151547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2779  flap endonuclease-1  30.65 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13915  predicted protein  26.34 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0963407  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03100  single-stranded DNA specific endodeoxyribonuclease, putative  38.61 
 
 		 1323 aa  83.6  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05216  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  26.69 
 
 		 1141 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_3874  predicted protein  27.27 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.301307  normal  0.764914 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03035  5'-3' exonuclease and flap-endonuclease (Eurofung)  29.3 
 
 		 761 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.799677 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33450  5'-3' exonuclease  27.94 
 
 		 676 aa  80.5  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35911  predicted protein  36.29 
 
 		 992 aa  80.1  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.3407  normal  0.878994 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_5620  predicted protein  26.97 
 
 		 333 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469951  normal  0.0101798 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38848  predicted protein  35.78 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03186  Rad2-like endonuclease, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13260)  27.31 
 
 		 822 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.861457 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07150  5' flap endonuclease, putative  26.23 
 
 		 643 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00080  exonuclease, putative  24.87 
 
 		 1012 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.008122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  27.08 
 
 		 903 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 936 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46971  predicted protein  25.31 
 
 		 696 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  26.03 
 
 		 299 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33639  predicted protein  21.76 
 
 		 894 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.224011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  25.17 
 
 		 908 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  23.56 
 
 		 894 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>