80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00530 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00530  urea transporter, putative  100 
 
 
674 aa  1366    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07373  solute symporter family transporter (AFU_orthologue; AFUA_6G03200)  45.93 
 
 
699 aa  585  1e-166  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52351  urea active transport protein  43.79 
 
 
724 aa  522  1e-147  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0516586  normal  0.828998 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00418  urea transporter (Dur3), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04870)  42.69 
 
 
693 aa  496  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119678  predicted protein  47.69 
 
 
709 aa  491  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20424  urea transporter  38.33 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55023  urea permease  38.31 
 
 
659 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.410596  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_768  predicted protein  38.26 
 
 
643 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530084  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32520  Urea active transport protein  34.21 
 
 
658 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02598  urea active transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17570)  31.73 
 
 
680 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.811341 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07557  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
692 aa  353  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314115  hitchhiker  0.00246133 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29213  urea transport protein  31.82 
 
 
668 aa  337  5e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57505  urea transport protein  30.12 
 
 
668 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20443  normal  0.667471 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49064  urea transport protein  31.2 
 
 
679 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.427526  normal  0.0261396 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0182  Na+/solute symporter  24.83 
 
 
478 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01880  Na+/proline symporter  24.25 
 
 
587 aa  106  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2635  sodium/solute transporter family urea transporter  24.12 
 
 
476 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.451328 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2263  sodium/solute transporter family urea transporter  24.46 
 
 
474 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0029  Na+/solute symporter  25.48 
 
 
488 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.080483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  23.78 
 
 
482 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0248  Na+/solute symporter  21.08 
 
 
500 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30460  Na+/proline symporter  24.5 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0720305  normal  0.147602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1604  Na+/solute symporter  22.75 
 
 
556 aa  85.1  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0772243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  26.09 
 
 
474 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  21.76 
 
 
464 aa  61.6  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  21.67 
 
 
483 aa  57.4  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.39 
 
 
592 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  22.61 
 
 
639 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.04 
 
 
593 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  22.65 
 
 
565 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  23.39 
 
 
539 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.67 
 
 
561 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  21.31 
 
 
564 aa  53.9  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  22.27 
 
 
633 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.19 
 
 
638 aa  52  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  24.89 
 
 
513 aa  50.8  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.62 
 
 
523 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  22.53 
 
 
461 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.41 
 
 
565 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  23.3 
 
 
476 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.36 
 
 
613 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 
596 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.11 
 
 
542 aa  48.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0686  Na+/solute symporter  23.31 
 
 
507 aa  48.1  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.663287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0688  Na+/solute symporter  22.75 
 
 
464 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.03 
 
 
522 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  20.94 
 
 
544 aa  47.4  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  22.94 
 
 
494 aa  47.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  21.1 
 
 
561 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  21.04 
 
 
490 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  27.41 
 
 
494 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  21.1 
 
 
561 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2137  SSS sodium solute transporter superfamily  22.3 
 
 
528 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00565072  normal  0.610314 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  22.83 
 
 
498 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.23 
 
 
513 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4721  Na+/solute symporter  24.8 
 
 
463 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0645  Na+/solute symporter  20.21 
 
 
472 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.646028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0688  Na+/solute symporter  20.57 
 
 
471 aa  45.8  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.217002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  21.17 
 
 
561 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  21.17 
 
 
561 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.9 
 
 
569 aa  45.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  20.8 
 
 
561 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.52 
 
 
570 aa  44.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23 
 
 
529 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.05 
 
 
487 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.91 
 
 
548 aa  44.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  21.17 
 
 
561 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  25.19 
 
 
524 aa  44.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.05 
 
 
492 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  22.95 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  24.02 
 
 
566 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  22.95 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 
554 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0507  Na+/solute symporter  23.34 
 
 
519 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.550362  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  24.54 
 
 
506 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  24.16 
 
 
477 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60304  urea transport protein  24.71 
 
 
520 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.087993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  22.37 
 
 
492 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>