53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0215 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0215  phage repressor protein, putative  100 
 
 
209 aa  418  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0406422  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  57.21 
 
 
211 aa  241  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  33.65 
 
 
219 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  33.33 
 
 
219 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.19 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.53 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  28.33 
 
 
214 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  31.93 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  30.08 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.87 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  33.91 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  33.91 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  21.72 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  33.73 
 
 
243 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  28.99 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.14 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  37.84 
 
 
120 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  23.92 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  23.41 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  25 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  34.18 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  28.32 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  26.67 
 
 
209 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  24.42 
 
 
217 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  29.46 
 
 
239 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.62 
 
 
206 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  27.21 
 
 
265 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  27.75 
 
 
244 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  24.51 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0804  hypothetical protein  41.86 
 
 
236 aa  45.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00564078  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1440  signal peptidase I, putative  30.95 
 
 
220 aa  44.7  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.54 
 
 
270 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  26.39 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  22.55 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  23.98 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  23.23 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  30.41 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  28.7 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  28.21 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  27.72 
 
 
200 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  23.7 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  30.43 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04120  transcriptional regulator  31.48 
 
 
129 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  20.67 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  25.84 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  21.74 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  20.75 
 
 
230 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  20.85 
 
 
217 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1794  peptidase S24 and S26 domain protein  29.11 
 
 
268 aa  41.6  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.854647  decreased coverage  0.00408927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  28.09 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  32.22 
 
 
209 aa  41.6  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>