255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3644 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.63 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  37.85 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  41.08 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.43 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.78 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  37.35 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.1 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.14 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  36.13 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.51 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.51 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  36.1 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  36.1 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  36.1 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  36.1 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  36.1 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.74 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  35.98 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  35.98 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.5 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  33.62 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  35.81 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.91 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.24 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.1 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  33.2 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.03 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.27 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  33.86 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.61 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.01 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  27.98 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  30.58 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.14 
 
 		 311 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  31.85 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.42 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  31.98 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.13 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.37 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.02 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  29.37 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  30.97 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.36 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  28.16 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.55 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  28.3 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.28 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  32.18 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  30.86 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.55 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.09 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  29.57 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  30.09 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.48 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  30.96 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.45 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  28.64 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.1 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.64 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.64 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  29.15 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  30.64 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  32.41 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.03 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  27.62 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.87 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  31.22 
 
 		 302 aa  99.4  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.22 
 
 		 302 aa  99.4  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  29.2 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.2 
 
 		 359 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.98 
 
 		 295 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.98 
 
 		 284 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.03 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  27.2 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  28.03 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  27.95 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.33 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  28.74 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.86 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.48 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  30 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  27.92 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  30.35 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.52 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  26.38 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.94 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  27.2 
 
 		 320 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>