58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1468 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 1674 aa  85.5  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1748 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  27.85 
 
 		 1726 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  28.22 
 
 		 1417 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 		 1700 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  27.39 
 
 		 1702 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  27.85 
 
 		 1956 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  28.1 
 
 		 1722 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  28.03 
 
 		 1649 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  31.43 
 
 		 1669 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  26.97 
 
 		 1701 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.18 
 
 		 1703 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1697 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  29.47 
 
 		 2098 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 1642 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  26.86 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.92 
 
 		 1697 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  27.09 
 
 		 1934 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  28.92 
 
 		 1669 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  26.92 
 
 		 1932 aa  72  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  26.79 
 
 		 1328 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  28.78 
 
 		 2077 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  25.64 
 
 		 2274 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 		 2570 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  26.53 
 
 		 1693 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  33.09 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  24.88 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 1516 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  25.39 
 
 		 1606 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 1925 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  25.6 
 
 		 1706 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 		 1575 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  25.71 
 
 		 2117 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.66 
 
 		 534 aa  53.9  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 1594 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  27.01 
 
 		 2005 aa  48.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.82 
 
 		 489 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  22.83 
 
 		 523 aa  45.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  22.83 
 
 		 523 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  23.14 
 
 		 528 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  25.91 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  23.74 
 
 		 515 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  25.3 
 
 		 389 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  23.29 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  25.25 
 
 		 595 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  28.33 
 
 		 515 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5430  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.25 
 
 		 527 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.73 
 
 		 673 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  25.45 
 
 		 517 aa  43.5  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  24.77 
 
 		 574 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.32 
 
 		 505 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1379  modification methylase NspV  31.93 
 
 		 534 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  23.61 
 
 		 814 aa  42  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1074  modification methylase NspV  31.93 
 
 		 550 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.77087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  30.61 
 
 		 1194 aa  42  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  24.09 
 
 		 873 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  28.33 
 
 		 995 aa  42  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>