17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1379 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1074  modification methylase NspV  92.23 
 
 
550 aa  1011    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.77087  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1379  modification methylase NspV  100 
 
 
534 aa  1109    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1700  modification methylase NspV  43.86 
 
 
484 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3822  modification methylase NspV  42.16 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378826  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3772  type II restriction enzyme NspV-like protein  42.16 
 
 
471 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2252  modification methylase NspV  64.47 
 
 
164 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  33.65 
 
 
1703 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  30.43 
 
 
494 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  33.65 
 
 
470 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  25.41 
 
 
673 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  27.63 
 
 
522 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  29.09 
 
 
1722 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2268  hypothetical protein  36.99 
 
 
142 aa  44.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  30.77 
 
 
1697 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 
677 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  22.71 
 
 
489 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  33.33 
 
 
1417 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>