72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1553 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.33 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.32 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  29.51 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  29.51 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  25.37 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.1 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.6 
 
 		 410 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.81 
 
 		 398 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  28.43 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.27 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  29.73 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  28.42 
 
 		 543 aa  62.4  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.51 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  23.86 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  27.37 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  22.02 
 
 		 403 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  22.4 
 
 		 453 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  22.4 
 
 		 453 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  25.14 
 
 		 333 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  22.35 
 
 		 405 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.25 
 
 		 400 aa  52.4  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.75 
 
 		 411 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.19 
 
 		 423 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 		 398 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  26.5 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  28.66 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  24.02 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.2 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 900 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 914 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.5 
 
 		 410 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.75 
 
 		 900 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  23.25 
 
 		 404 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  23.86 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  25.67 
 
 		 484 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.26 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  28.4 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.43 
 
 		 432 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  29.69 
 
 		 410 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.79 
 
 		 415 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  25.43 
 
 		 440 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.5 
 
 		 405 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  25.26 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2476  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.31 
 
 		 947 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  28.32 
 
 		 347 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  23.78 
 
 		 321 aa  46.2  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3289  protein of unknown function DUF201  24.62 
 
 		 361 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0509227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.05 
 
 		 541 aa  46.2  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0021  hypothetical protein  24.6 
 
 		 382 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  26.21 
 
 		 414 aa  45.4  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  26.21 
 
 		 414 aa  45.4  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  23.56 
 
 		 449 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  24.07 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.58 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  26.21 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.42 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.26 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.26 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.89 
 
 		 408 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  24.21 
 
 		 397 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.83 
 
 		 410 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  23.53 
 
 		 430 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.9 
 
 		 326 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1544  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  23.2 
 
 		 447 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  hitchhiker  0.00898283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25.32 
 
 		 414 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  26.16 
 
 		 308 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  27.42 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  37.5 
 
 		 402 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  29.45 
 
 		 401 aa  42  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  26.76 
 
 		 431 aa  42  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>