96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1410 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  100 
 
 
140 aa  266  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  63.5 
 
 
144 aa  176  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  61.15 
 
 
145 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  67.14 
 
 
153 aa  174  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  62.86 
 
 
142 aa  173  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  62.86 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  63.77 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  56.12 
 
 
146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  58.99 
 
 
145 aa  160  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  56.83 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.96 
 
 
143 aa  157  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  58.96 
 
 
143 aa  158  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  62.77 
 
 
143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  62.77 
 
 
143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  62.77 
 
 
143 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.71 
 
 
145 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  59.42 
 
 
144 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  55.71 
 
 
145 aa  146  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.56 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  55.56 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.8 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55 
 
 
145 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  55.4 
 
 
146 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.55 
 
 
138 aa  137  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.42 
 
 
145 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  51.45 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  57.86 
 
 
142 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.67 
 
 
146 aa  129  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  129  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  56.43 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  48.92 
 
 
293 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.47 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.18 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  57.94 
 
 
141 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.92 
 
 
144 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  53.91 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.17 
 
 
137 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.92 
 
 
287 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  48.87 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.77 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 
141 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.36 
 
 
137 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.44 
 
 
142 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.7 
 
 
142 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  42.96 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  42.96 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  42.25 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  43.66 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  43.66 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  37.23 
 
 
139 aa  97.1  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.22 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.22 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  41.48 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  36.89 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 
160 aa  62.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.95 
 
 
311 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  25.93 
 
 
307 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.93 
 
 
300 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.93 
 
 
289 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  25.93 
 
 
300 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  26.39 
 
 
291 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  25.93 
 
 
300 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  33.33 
 
 
273 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.93 
 
 
302 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  28.23 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.7 
 
 
312 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  30 
 
 
298 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.7 
 
 
313 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  34.15 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0899  hypothetical protein  30.63 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.7 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  28.99 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 
298 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  42.86 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 
285 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 
298 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1822  hypothetical protein  30.23 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  25.19 
 
 
302 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2006  hypothetical protein  26.62 
 
 
307 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353305  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  25.19 
 
 
302 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  25.42 
 
 
305 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0834  hypothetical protein  28.26 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.38 
 
 
318 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  25.19 
 
 
281 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  25.9 
 
 
307 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>