More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2139 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2139  DJ-1/PfpI family protein  100 
 
 
198 aa  408  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0723  ThiJ/PfpI domain protein  45.13 
 
 
199 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286561  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.33 
 
 
227 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.3 
 
 
226 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.19 
 
 
237 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.35 
 
 
241 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  38.69 
 
 
211 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  38.14 
 
 
199 aa  137  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  39.09 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  36.79 
 
 
284 aa  125  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  34.04 
 
 
212 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.07 
 
 
225 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.57 
 
 
207 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.58 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.48 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  29.57 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06760  conserved hypothetical protein  27.54 
 
 
234 aa  92  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130038  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.45 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6949  ThiJ/PfpI family protein  30.68 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0470534  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  32.24 
 
 
199 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  31.28 
 
 
233 aa  89.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  29.19 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 
320 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  31.72 
 
 
229 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2244  ThiJ/PfpI domain protein  32.79 
 
 
222 aa  88.2  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121957  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.41 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  31.86 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.55 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  31.34 
 
 
207 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  28.87 
 
 
202 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3890  ThiJ/PfpI domain protein  30.11 
 
 
228 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4003  ThiJ/PfpI domain protein  30.11 
 
 
228 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448495  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  32.42 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  29.26 
 
 
245 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.26 
 
 
245 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 
311 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.26 
 
 
245 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.64 
 
 
225 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 
311 aa  85.5  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.57 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1474  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.12 
 
 
242 aa  85.1  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.51 
 
 
233 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  28.14 
 
 
312 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
357 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  30.51 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  31.07 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  28.65 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0161  ThiJ/PfpI domain protein  30.57 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0374821  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  31.64 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  30.27 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  24 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.88 
 
 
249 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.51 
 
 
224 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
321 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.29 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  28.14 
 
 
349 aa  81.3  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.72 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.18 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.73 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  26.67 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  29.19 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 
338 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
351 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
324 aa  79  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.34 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  26.94 
 
 
198 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  24.73 
 
 
327 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.44 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  27.12 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 
209 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3881  transcriptional regulator  28.73 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5828  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 
312 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  29.17 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  29.78 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.8 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  22.5 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  29.38 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  28.42 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0639  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.42 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  31.02 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 
338 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  28.73 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  27.53 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  28.73 
 
 
228 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 
322 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  28.81 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  28.81 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  30.77 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  28.81 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  25.27 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  28.81 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>