More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1082 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  100 
 
 
366 aa  732    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3846  putative glycosyltransferase  39.04 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0833  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609778  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
375 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
355 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3874  putative glycosyltransferase  35.09 
 
 
361 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.59519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0811  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
387 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
379 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2730  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.9123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.28 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
436 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  27.47 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  38.62 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
930 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
756 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0967  hypothetical protein  23.34 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.43 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  25.22 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  35.77 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
518 aa  69.3  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.27 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  28.21 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
386 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
385 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0561  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
325 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
505 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  29 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
393 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
409 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
401 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
372 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0953  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517229  normal  0.256855 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  28.37 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  26.58 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1694  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
1080 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  23.89 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>