More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0567 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0567  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
267 aa  550  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000057377  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0566  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.71 
 
 
273 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000469467  normal  0.441502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0806  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0669988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3350  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.219345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2546  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
259 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  33.18 
 
 
251 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.87 
 
 
264 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1666  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.36 
 
 
259 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.458425  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2706  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
296 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.16 
 
 
269 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.78 
 
 
267 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4297  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4614  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0581  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3837  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0540  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.75 
 
 
245 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0616524  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6045  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  27.92 
 
 
270 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3179  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608848  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1016  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.86 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2935  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.51 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  27.98 
 
 
279 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3551  short chain enoyl-CoA hydratase  32.47 
 
 
259 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.73 
 
 
287 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0474  enoyl-CoA hydratase  26.98 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02414  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.43 
 
 
266 aa  92  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0388  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
254 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1548  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.09 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4537  enoyl-CoA hydratase  29.44 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1434  enoyl-CoA hydratase  30.53 
 
 
308 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193072  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  27.84 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2745  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0301258  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2106  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2718  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.189949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1560  enoyl-CoA hydratase  29.39 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2433  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
260 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707416  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0389  enoyl-CoA hydratase  30.36 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00593018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.69 
 
 
260 aa  89  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3908  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31 
 
 
245 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.11 
 
 
268 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  27.86 
 
 
275 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4035  enoyl-CoA hydratase  30.13 
 
 
256 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4219  enoyl-CoA hydratase  29.09 
 
 
260 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001541  methylglutaconyl-CoA hydratase  28.71 
 
 
279 aa  88.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1736  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.841182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  26.76 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1455  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.57 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3240  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00596711  hitchhiker  0.0000100182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0749  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.102863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  27.57 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0721  enoyl-CoA hydratase  31 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000678732  hitchhiker  0.00168791 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.57 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.044471  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1228  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115754  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2511  enoyl-CoA hydratase  33.15 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1575  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.84 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524815 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3582  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000838255  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0802  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000721466  hitchhiker  0.00000000959721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1938  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0777  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.5 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1856  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.34 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.128086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1598  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.3 
 
 
261 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.18 
 
 
267 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2974  methylglutaconyl-CoA hydratase  27.4 
 
 
258 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.240508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0764  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
245 aa  87  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.63 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05478  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.36 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.87 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4526  enoyl-CoA hydratase  27.73 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.81 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  32.29 
 
 
246 aa  85.5  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1499  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1610  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.06 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4127  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.32 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128801  normal  0.190874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1343  enoyl-CoA hydratase  33.84 
 
 
264 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.5 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000610826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  30.81 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3291  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.38 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  32.31 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.47 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3753  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  31.11 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3826  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0730  enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.365771  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3765  enoyl-CoA hydratase  28.64 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1266  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192024  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.1 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.98 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1028  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.38 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  27.15 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.58 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0352  enoyl-CoA hydratase  30.85 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.01 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1173  enoyl-CoA hydratase  32.61 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1271  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0748368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>