More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B3005 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  93.25 
 
 		 252 aa  427  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  68.55 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  68.25 
 
 		 279 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  68.25 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 246 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 246 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  65.73 
 
 		 254 aa  330  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  65.32 
 
 		 254 aa  329  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  66.53 
 
 		 254 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  64.52 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  65.99 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  65.99 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  65.59 
 
 		 253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  67.6 
 
 		 311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  34.55 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  30.71 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.18 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  30.21 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  30.33 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  39.37 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  28.64 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  29.96 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.5 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.56 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05398  oxidoreductase protein  33.17 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.979699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  26.89 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.13 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.74 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  25.63 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  28.4 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 261 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  30.65 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7662  short-chain dehydrogenase  29.58 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.281349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.13 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.92 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2916  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.72 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.15 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  28.09 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0055984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  32.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  29.92 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>