More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2338 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  100 
 
 		 470 aa  928    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  62.68 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  62.68 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  62.68 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  63.71 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  62.68 
 
 		 508 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  62.68 
 
 		 506 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  62.68 
 
 		 508 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  60.84 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5881  RND efflux system outer membrane lipoprotein  62.17 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  58.69 
 
 		 495 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  58.89 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  55.22 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  57.64 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  59.34 
 
 		 491 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.33 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  51.56 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.44 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.47 
 
 		 514 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.9 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  47.9 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  46.85 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.59 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.59 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.75 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.88 
 
 		 474 aa  364  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  45.24 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2359  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.98 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477892  normal  0.303291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1499  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  52.13 
 
 		 502 aa  362  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  45.32 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.68 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.81 
 
 		 485 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  45.56 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.61 
 
 		 489 aa  355  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.37 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.96 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.57 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.64 
 
 		 483 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.8 
 
 		 485 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.76 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  45.56 
 
 		 485 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  45.56 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.71 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.61 
 
 		 505 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  44.89 
 
 		 474 aa  349  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.45 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  45.45 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  44.89 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.35 
 
 		 477 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1337  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.49 
 
 		 471 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  47.67 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.04 
 
 		 515 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  45.89 
 
 		 487 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.1 
 
 		 472 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  45.98 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  45.7 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.68 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.47 
 
 		 487 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  46.46 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.86 
 
 		 503 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  46.68 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.49 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.3 
 
 		 507 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.54 
 
 		 485 aa  335  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.68 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.27 
 
 		 486 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.91 
 
 		 462 aa  335  1e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.58 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.06 
 
 		 507 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.48 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.06 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.93 
 
 		 467 aa  333  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  45.3 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.73 
 
 		 516 aa  333  6e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  45.3 
 
 		 513 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44 
 
 		 517 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  44.7 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.53 
 
 		 510 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  45.3 
 
 		 516 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2896  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.58 
 
 		 477 aa  330  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.51 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44 
 
 		 484 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.77 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.77 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.14 
 
 		 477 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.77 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  44.77 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  44.77 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  44.77 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.78 
 
 		 484 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.78 
 
 		 484 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  42.83 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  44.56 
 
 		 512 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  44.56 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.56 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.45 
 
 		 507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.56 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  44.56 
 
 		 514 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>