More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1453 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1453  putative cysteine desulfurase  100 
 
 		 381 aa  749    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273415  hitchhiker  0.00591907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1582  aminotransferase, class V  71.87 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.533232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1412  aminotransferase class V  56 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 407 aa  299  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.85 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  44.89 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  47.49 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  44.71 
 
 		 400 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  41.76 
 
 		 384 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  43.16 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  43.13 
 
 		 404 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  42.67 
 
 		 399 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  41.76 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  42.74 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.58 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  43.65 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  41.33 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  39.95 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.37 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5907  cysteine desulfurase  47.33 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.469117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  44.85 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  44.59 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  44.97 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  41.07 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  44.44 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  41.51 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  40.96 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  40.96 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  44.33 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  41.87 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.44 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  41.87 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.6 
 
 		 404 aa  272  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.72 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  48.25 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  41.22 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  44.83 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  40 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1537  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.417733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1253  aminotransferase class V  46.84 
 
 		 393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  43.8 
 
 		 407 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  40.16 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  39.63 
 
 		 402 aa  269  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.17 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  42.9 
 
 		 394 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  42.48 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  45.07 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.83 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  38.56 
 
 		 394 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.64 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  47.64 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  41.33 
 
 		 389 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  38.3 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.41 
 
 		 1143 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.6 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  38.83 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  41.33 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 401 aa  259  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.08 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  36.58 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  47.98 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.47 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0212  cysteine desulfurase  48.41 
 
 		 382 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.133802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  40.43 
 
 		 402 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  36.53 
 
 		 414 aa  255  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  34.31 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  36.83 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  36.58 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4051  Cysteine desulfurase  41.14 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0863916  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  35.64 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  44.9 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  40.27 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  42.63 
 
 		 1139 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  44.29 
 
 		 399 aa  252  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  40.16 
 
 		 385 aa  252  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  35.73 
 
 		 392 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  35.66 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  35.66 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.32 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.41 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3560  aminotransferase class V  45.7 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0251631  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.77 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  38.42 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  36.7 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1186  aminotransferase, class V  36.41 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.66 
 
 		 383 aa  245  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  36.91 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1680  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.399532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1713  aminotransferase class V  37.23 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.229931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  36.05 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  37.87 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>