More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0732 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0732  ABC bacteriocin/lantibiotic exporter, fused ATPase inner membrane and peptidase subunits  100 
 
 
705 aa  1436    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3454  ABC transporter related  78.93 
 
 
706 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  31.23 
 
 
706 aa  342  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3330  ABC transporter related  31.09 
 
 
706 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480846  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4187  ABC transporter related  31.09 
 
 
706 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.238139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4179  ABC transporter related  31.09 
 
 
706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.631711  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1818  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 
707 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1734  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.5 
 
 
707 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1322  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 
707 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0655788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1000  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 
707 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0293  peptidase  29.35 
 
 
707 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0274  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.35 
 
 
707 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0259681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1138  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.21 
 
 
707 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  29.64 
 
 
721 aa  311  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  28.88 
 
 
695 aa  308  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  29.91 
 
 
725 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  31.94 
 
 
714 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.92 
 
 
699 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  32.05 
 
 
712 aa  301  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  29.17 
 
 
726 aa  296  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  30.07 
 
 
719 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.23 
 
 
733 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03510  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  28.39 
 
 
724 aa  289  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  32.92 
 
 
767 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  30.42 
 
 
719 aa  287  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  29.45 
 
 
726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  27.89 
 
 
704 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  27.89 
 
 
704 aa  283  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.89 
 
 
704 aa  283  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 
707 aa  278  3e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  29.93 
 
 
707 aa  277  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  29.13 
 
 
723 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.68 
 
 
719 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  29.28 
 
 
723 aa  273  9e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  29.38 
 
 
772 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3643  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.33 
 
 
753 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2821  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.38 
 
 
753 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.608237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2949  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.3 
 
 
770 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3156  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.036278  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0045  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1722  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  29.38 
 
 
753 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106916  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  29.62 
 
 
696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  29.57 
 
 
723 aa  266  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  29.03 
 
 
739 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  30.26 
 
 
704 aa  265  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.59 
 
 
683 aa  261  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  28.74 
 
 
723 aa  260  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  28.74 
 
 
723 aa  260  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.49 
 
 
719 aa  258  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  29.7 
 
 
918 aa  250  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  28.98 
 
 
688 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  28.53 
 
 
720 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  26.43 
 
 
726 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2317  ABC transporter-related protein  28.37 
 
 
711 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0427514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.69 
 
 
743 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3755  ABC transporter related  27.9 
 
 
707 aa  225  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561947  normal  0.0200117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  24.5 
 
 
737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.63 
 
 
1019 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  24.58 
 
 
727 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  28.81 
 
 
721 aa  217  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  27.83 
 
 
695 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  27.67 
 
 
727 aa  211  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  26.06 
 
 
727 aa  207  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  26.99 
 
 
1038 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  23.57 
 
 
760 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
1038 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.39 
 
 
1040 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  27.08 
 
 
908 aa  200  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  24.1 
 
 
739 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  26.47 
 
 
725 aa  198  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.54 
 
 
738 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.75 
 
 
1018 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  24.63 
 
 
721 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  26.32 
 
 
1018 aa  191  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  23.52 
 
 
716 aa  191  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  24.75 
 
 
1042 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  26 
 
 
1675 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  25.44 
 
 
724 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  25.44 
 
 
724 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.04 
 
 
1018 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0873  ATPase  25.04 
 
 
724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  24.02 
 
 
734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  24.86 
 
 
722 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  25.88 
 
 
1011 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  24.93 
 
 
715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  22.14 
 
 
727 aa  185  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  25.8 
 
 
732 aa  185  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2331  ABC transporter-related protein  25.84 
 
 
724 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  23.89 
 
 
715 aa  183  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  23.64 
 
 
725 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  23.1 
 
 
736 aa  182  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  23.74 
 
 
734 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  24.48 
 
 
738 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2503  ATPase  27.48 
 
 
715 aa  181  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.479102  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.61 
 
 
908 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  24.69 
 
 
730 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  24.45 
 
 
734 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  24.1 
 
 
741 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  24.27 
 
 
930 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>