More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1832 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  86.84 
 
 
415 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  86.4 
 
 
415 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  85.96 
 
 
415 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  85.99 
 
 
469 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  100 
 
 
420 aa  835    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  86.4 
 
 
415 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  86.2 
 
 
415 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  86.4 
 
 
415 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.36 
 
 
396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  28.78 
 
 
409 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.4 
 
 
391 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  29.29 
 
 
409 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  28.81 
 
 
410 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.58 
 
 
394 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2287  multidrug resistance protein D  29.68 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.754315  hitchhiker  0.0000100188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
406 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.91 
 
 
465 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.693691  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.12 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  30.72 
 
 
400 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02654  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.05 
 
 
400 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  29.37 
 
 
403 aa  131  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.72 
 
 
402 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.53 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.09 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04810  Xaa-His dipeptidase  36.36 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1989  multidrug resistance protein D  28.31 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.53 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.53 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  28.38 
 
 
392 aa  130  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1936  multidrug resistance protein D  26.72 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000117708 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2040  multidrug resistance protein D  26.72 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001081  multidrug resistance protein D  33.7 
 
 
394 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.25 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  31.94 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  34.76 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.94 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.82 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.31 
 
 
412 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  31.65 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.54 
 
 
393 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.06 
 
 
398 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2267  multidrug resistance protein D  27.71 
 
 
410 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2085  multidrug resistance protein D  27.71 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.88065  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2329  multidrug resistance protein D  26.69 
 
 
408 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000177786  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2384  multidrug resistance protein D  27.71 
 
 
410 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214025  hitchhiker  0.000132803 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 
396 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 
396 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.68 
 
 
396 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.02 
 
 
393 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2389  multidrug resistance protein D  27.07 
 
 
414 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.78 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2078  multidrug resistance protein D  25.74 
 
 
410 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.1442  hitchhiker  0.00000857713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2030  multidrug resistance protein D  25.98 
 
 
422 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.78 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.19 
 
 
405 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.52 
 
 
392 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2014  bicyclomycin resistance protein  30.77 
 
 
399 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0373482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.79 
 
 
401 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.82 
 
 
396 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.82 
 
 
396 aa  123  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1312  major facilitator transporter  32.15 
 
 
388 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.19 
 
 
405 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  28.91 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.5 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.46 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 
458 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  24.71 
 
 
407 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 
402 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  31.43 
 
 
401 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.3 
 
 
402 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.92 
 
 
396 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1734  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.38 
 
 
435 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.68 
 
 
405 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  29.47 
 
 
401 aa  119  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.19 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1144  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.27 
 
 
395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.71 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  27.78 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.58 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  37.06 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.35 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.16 
 
 
408 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4430  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.7 
 
 
454 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0528088  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.45 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  36.32 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2778  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.4 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.276165  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.98 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0372929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.16 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  36.81 
 
 
394 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>