More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2111 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0453  amidohydrolase  78.05 
 
 		 401 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.719857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  80.8 
 
 		 404 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3092  hippurate hydrolase  75.89 
 
 		 397 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0770  amidohydrolase  79.4 
 
 		 403 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3382  amidohydrolase  74.81 
 
 		 402 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1248  amidohydrolase  79.04 
 
 		 425 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.144528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0333  amidohydrolase  77.97 
 
 		 401 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3615  peptidase M20D, amidohydrolase  80.6 
 
 		 397 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  100 
 
 		 398 aa  828    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0444  amidohydrolase  78.05 
 
 		 401 aa  660    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1132  amidohydrolase  71.93 
 
 		 402 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  69.37 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  67.17 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3113  amidohydrolase  66.75 
 
 		 396 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2533  peptidase M20D, amidohydrolase  69.29 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2748  amidohydrolase  66.67 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2871  putative hippurate hydrolase protein  66.33 
 
 		 396 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000867409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0472  putative hippurate carboxypeptidase, M20D- type  62.47 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3484  amidohydrolase  62.37 
 
 		 398 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00282847  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  62.37 
 
 		 396 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2687  amidohydrolase  61.27 
 
 		 397 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5843  amidohydrolase  59.09 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5626  amidohydrolase  59.39 
 
 		 399 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.528848  normal  0.0552178 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4653  amidohydrolase  59.34 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0295739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3715  peptidase M20D, amidohydrolase  59.34 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5651  amidohydrolase  59.34 
 
 		 396 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5224  amidohydrolase  54.16 
 
 		 401 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  53 
 
 		 389 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0943  amidohydrolase  54.36 
 
 		 417 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  54.82 
 
 		 390 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1569  amidohydrolase  51.59 
 
 		 387 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115888  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1550  amidohydrolase  51.85 
 
 		 387 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1519  amidohydrolase  51.84 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1624  amidohydrolase  51.59 
 
 		 387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538958  hitchhiker  0.00444937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1649  amidohydrolase  51.59 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4547  amidohydrolase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  0.196553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1825  amidohydrolase  51.72 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0704154  normal  0.023648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2955  peptidase M20D, amidohydrolase  51.72 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0814312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1169  peptidase M20D, amidohydrolase  51.59 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3821  peptidase M20D, amidohydrolase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.961686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  48.85 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  48.81 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1298  peptidase M20D, amidohydrolase  48.35 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  48.98 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4797  peptidase M20D, amidohydrolase  50.79 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1589  amidohydrolase  51.32 
 
 		 387 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.855495  normal  0.041045 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  48.35 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  52.22 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  49.34 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2476  amidohydrolase  49.63 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3971  amidohydrolase  47.84 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1941  hippurate hydolase  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1662  hypothetical protein  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0958  hippurate hydolase  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2220  hippurate hydolase  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0217  hippurate hydolase  48.35 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3358  amidohydrolase  48.61 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445234  normal  0.0286495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0205  amidohydrolase family protein  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0295  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  52.22 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4433  amidohydrolase  47.33 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1245  hippurate hydolase  48.6 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0689013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4914  putative hydrolase  50 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5519  amidohydrolase  50.26 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  48.98 
 
 		 390 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  48.35 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6670  amidohydrolase  48.6 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5374  amidohydrolase  48.86 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56480  putative hydrolase  48.19 
 
 		 406 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4896  amidohydrolase  48.86 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.873901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2992  peptidase M20D, amidohydrolase  48.86 
 
 		 399 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6435  peptidase M20D, amidohydrolase  48.6 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6067  amidohydrolase  48.59 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6364  amidohydrolase  48.59 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.557183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6268  amidohydrolase  48.6 
 
 		 395 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.843577  normal  0.0558872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3769  amidohydrolase  50.13 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0252  peptidase M20D, amidohydrolase  47.85 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2871  peptidase M20D, amidohydrolase  50.13 
 
 		 391 aa  378  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5133  amidohydrolase  49.87 
 
 		 407 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.519765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  47.78 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5250  amidohydrolase  48.86 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  50.13 
 
 		 379 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4721  amidohydrolase  49.11 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2037  M20/M25/M40 family peptidase  50.13 
 
 		 387 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.403946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2573  amidohydrolase  52.89 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0165265  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  48.37 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  48.5 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  48.51 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  49.37 
 
 		 388 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  46.68 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0051  peptidase M20D, amidohydrolase  47.53 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  48.62 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1959  M20/M25/M40 family peptidase  49.87 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  49 
 
 		 390 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  45.71 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2175  peptidase M20D, amidohydrolase  48.35 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.20985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0901  amidohydrolase  49.87 
 
 		 387 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  45.71 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  47.73 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  47.36 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>