More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4190 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  90.53 
 
 		 338 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  100 
 
 		 338 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  90.24 
 
 		 338 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  63.2 
 
 		 339 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  52.84 
 
 		 340 aa  335  9e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  49.85 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  48.65 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  48.55 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  48.26 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  45.56 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.39 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  48.35 
 
 		 346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  47.09 
 
 		 341 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  46.27 
 
 		 323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  47.81 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.34 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  47.59 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  47.68 
 
 		 329 aa  288  7e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  45.26 
 
 		 328 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.05 
 
 		 352 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  42.57 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  42.46 
 
 		 339 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.46 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  41.85 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.06 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 338 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 338 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  40.36 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  44.08 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  45.57 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  45.57 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  42.6 
 
 		 334 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  45.85 
 
 		 314 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  42.77 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.16 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  43.07 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  41.27 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  40.56 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  44.27 
 
 		 313 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  40.36 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  42.86 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.41 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.41 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.1 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  39.1 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  42.11 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  38.81 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.81 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3075  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.69 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.51 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  43.12 
 
 		 345 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  39.06 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  45.95 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.94 
 
 		 373 aa  209  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1289  Pyridoxal 4-dehydrogenase  37.85 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.911185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  33.93 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  31.02 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.19 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  30.65 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.95 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  29.66 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  28.53 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  33.01 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  25.16 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  29.97 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  25.17 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2795  aldo/keto reductase  27.66 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  26.13 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  26.73 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  27.22 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  26.63 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  25.36 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  26.44 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  26.44 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.44 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  26.44 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  25 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.06 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1455  aldo/keto reductase  26.51 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  27.99 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  26.96 
 
 		 314 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  27.55 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.17 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.17 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.17 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.17 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.56 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  23.56 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.58 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>