More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5135 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  836    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  78.59 
 
 		 418 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  69.06 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  66.42 
 
 		 439 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  66.42 
 
 		 439 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  39.47 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  35.93 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 424 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  33.53 
 
 		 407 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2452  hypothetical protein  27.36 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  41.51 
 
 		 217 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  27.29 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  26.22 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  27.78 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  27.78 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 403 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  24.23 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  20.69 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 392 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  24.23 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 400 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.23 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  25.62 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  23.31 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.23 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  25.18 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2559  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  28 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.87 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  25.6 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  26.21 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  22.91 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  24.5 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  24.55 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  26.21 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  26.21 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  26.21 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  26.21 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.23 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  28.44 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  28.68 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  25.07 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  31.17 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  25.93 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  21.6 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.07 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  26.05 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  23.88 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  23.01 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>