More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1849 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  73.11 
 
 		 229 aa  300  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  72.17 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  72.95 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  72.46 
 
 		 202 aa  292  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  81.5 
 
 		 175 aa  291  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  81.5 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  81.5 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  81.5 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  81.5 
 
 		 175 aa  290  8e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  81.5 
 
 		 175 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  80.35 
 
 		 175 aa  287  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 175 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  80.95 
 
 		 169 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  74.38 
 
 		 162 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  76.1 
 
 		 161 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  75.47 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  75.47 
 
 		 161 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 154 aa  191  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 155 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 157 aa  187  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 154 aa  187  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  57.52 
 
 		 155 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 156 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 158 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 155 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 162 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 153 aa  157  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 165 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2709  AsnC family transcriptional regulator  80.43 
 
 		 161 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  46.34 
 
 		 169 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6504  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845269  normal  0.499109 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3248  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157237  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4915  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903726  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 159 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  49.68 
 
 		 161 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  46.71 
 
 		 159 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 		 156 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 147 aa  145  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 157 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  48.03 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.39 
 
 		 163 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 159 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48 
 
 		 153 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  48.7 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 159 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 160 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 154 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 153 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 164 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 164 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 152 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 177 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 154 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 156 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 		 155 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.5 
 
 		 162 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 152 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  47.33 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  43.33 
 
 		 164 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>