More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0363 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  316  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4061  MarR family transcriptional regulator  78.01 
 
 		 170 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0638  transcriptional regulator, MarR family  77.3 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0174  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.63734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2774  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0654  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536381  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2385  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0670  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2305  MarR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6072  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 148 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 148 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 148 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2661  MarR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 148 aa  208  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 148 aa  208  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0555  MarR family transcriptional regulator  69.93 
 
 		 148 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3479  transcriptional regulator, MarR family  56.95 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.891709  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4551  transcriptional regulator, MarR family  56.95 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01785  transcription regulator protein  57.55 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  49.33 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  36.84 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  34.62 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  39.33 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  34.83 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  35.96 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  30.83 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 267 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  37.65 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  41.43 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>