50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2418 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2418  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1206  TPR domain-containing protein  25.64 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.417505  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.5 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.97 
 
 		 643 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 717 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 1034 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.21 
 
 		 668 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1038 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 717 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.63 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 358 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 366 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1005 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 		 689 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0164  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 963 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 		 880 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3871  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 196 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1428  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 413 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.2 
 
 		 581 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.45 
 
 		 622 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  41.18 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 722 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0237  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 984 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.47 
 
 		 1237 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 468 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0993  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 477 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0358933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  27.33 
 
 		 1157 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 864 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 377 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 409 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 762 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 373 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 1737 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 594 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.35 
 
 		 887 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 718 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 265 aa  42  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 594 aa  42  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.5 
 
 		 264 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 265 aa  42  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 466 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 265 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  30.93 
 
 		 931 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 781 aa  41.6  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>