More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2333 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2333  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 
353 aa  704    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000272884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 
359 aa  270  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2424  3-dehydroquinate synthase  43.28 
 
 
354 aa  269  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  40.96 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.69 
 
 
355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  41.76 
 
 
358 aa  265  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  41.69 
 
 
359 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 
359 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  40.68 
 
 
359 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  41.45 
 
 
358 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07971  3-dehydroquinate synthase  42.98 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.277449  hitchhiker  0.00421114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  41.39 
 
 
359 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  42.32 
 
 
359 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0525  3-dehydroquinate synthase  40.84 
 
 
368 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 
359 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1423  3-dehydroquinate synthase  43.86 
 
 
356 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000905299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  41.91 
 
 
367 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2167  3-dehydroquinate synthase  43.58 
 
 
369 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.563786  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  38.04 
 
 
367 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  41.25 
 
 
366 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  41.25 
 
 
366 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  43.41 
 
 
361 aa  259  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 
358 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  43.11 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  39.26 
 
 
361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  41.09 
 
 
358 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 
356 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  40.59 
 
 
358 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  40.4 
 
 
363 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1003  3-dehydroquinate synthase  40.23 
 
 
376 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  40.8 
 
 
364 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2025  3-dehydroquinate synthase  41.03 
 
 
362 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  40.79 
 
 
359 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1854  3-dehydroquinate synthase  42.06 
 
 
359 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0869188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  41.11 
 
 
359 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  39.64 
 
 
359 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0688  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 
350 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  42.23 
 
 
368 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0689  3-dehydroquinate synthase  41.3 
 
 
350 aa  256  6e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0401  3-dehydroquinate synthase  43.79 
 
 
366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  45.08 
 
 
388 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0116  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0690  3-dehydroquinate synthase  40.97 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  41.4 
 
 
368 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  39.6 
 
 
363 aa  253  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  41.47 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  38.44 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07421  3-dehydroquinate synthase  41.19 
 
 
368 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00250573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 
368 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  40.41 
 
 
365 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 
354 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  40.58 
 
 
367 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
376 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 
362 aa  251  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0088  3-dehydroquinate synthase  42.6 
 
 
361 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.627876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  42.94 
 
 
362 aa  251  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02181  3-dehydroquinate synthase  38.11 
 
 
370 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1020  3-dehydroquinate synthase  45.85 
 
 
349 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  40.63 
 
 
366 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  39.35 
 
 
368 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
365 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0696  3-dehydroquinate synthase  42.99 
 
 
352 aa  250  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.701677  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 
365 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1241  3-dehydroquinate synthase  44.37 
 
 
361 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  40.54 
 
 
374 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0682  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
363 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.833789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  41.32 
 
 
357 aa  249  6e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  40.29 
 
 
359 aa  249  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 
359 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  40.48 
 
 
370 aa  248  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  41.02 
 
 
359 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  41.57 
 
 
369 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  41.16 
 
 
366 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
359 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  40.7 
 
 
363 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0610  3-dehydroquinate synthase  39.38 
 
 
370 aa  246  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  39.66 
 
 
367 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07351  3-dehydroquinate synthase  40.54 
 
 
363 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.374407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  39.37 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  39.71 
 
 
350 aa  245  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0372  3-dehydroquinate synthase  40.9 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  40.3 
 
 
373 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1218  3-dehydroquinate synthase  42.13 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000176451  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0691  3-dehydroquinate synthase  39.09 
 
 
370 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0085  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  40.12 
 
 
368 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  41.64 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2660  3-dehydroquinate synthase  40.76 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0978  3-dehydroquinate synthase  41.52 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105687  normal  0.163627 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1202  3-dehydroquinate synthase  39.94 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  40.35 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0393  3-dehydroquinate synthase  40.6 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>