More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5148 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  92.48 
 
 
399 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  91.98 
 
 
424 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  91.48 
 
 
399 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  91.23 
 
 
399 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
399 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  92.73 
 
 
399 aa  719    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  71.07 
 
 
398 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  68.53 
 
 
398 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  54.26 
 
 
407 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
398 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  49.63 
 
 
400 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  49.63 
 
 
414 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  55.58 
 
 
408 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  55.58 
 
 
408 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 
398 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  55.58 
 
 
408 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
425 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  48.31 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  54.36 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 
402 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  47.04 
 
 
402 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
395 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  45.57 
 
 
395 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  46.23 
 
 
397 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  47.81 
 
 
402 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  51.74 
 
 
371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  51.74 
 
 
371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  51.74 
 
 
371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  51.74 
 
 
371 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 
393 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  44.36 
 
 
394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 
377 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  42.41 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  43.31 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
400 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  41.97 
 
 
400 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 
400 aa  296  5e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  47.78 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  41.1 
 
 
398 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.89 
 
 
393 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 
394 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 
396 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.6 
 
 
398 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 
396 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.58 
 
 
463 aa  276  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.7 
 
 
406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.25 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
383 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  40.49 
 
 
417 aa  272  8.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  41.34 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  41.34 
 
 
393 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  41.52 
 
 
421 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 
393 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.45 
 
 
399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  41.09 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  41.86 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
413 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.4 
 
 
404 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.86 
 
 
393 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
411 aa  263  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
416 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  44.42 
 
 
402 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
399 aa  260  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  37.27 
 
 
433 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 
396 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 
403 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.26 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  37.73 
 
 
386 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
406 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  44.1 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 
432 aa  252  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
386 aa  253  6e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 
403 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  40.41 
 
 
411 aa  249  5e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
393 aa  248  9e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
411 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
437 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  39.45 
 
 
420 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
397 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 
401 aa  245  8e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 
394 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.53 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>