More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3446 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  95.22 
 
 
252 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  95.22 
 
 
266 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  94.02 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  94.42 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  94.42 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  94.42 
 
 
252 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
407 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  84.13 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  82.54 
 
 
348 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  76.49 
 
 
251 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5063  DeoR family transcriptional regulator  73.31 
 
 
251 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.547667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4788  transcriptional regulator, DeoR family  75.7 
 
 
251 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478431  hitchhiker  0.0000516883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3722  DeoR family transcriptional regulator  58.8 
 
 
251 aa  288  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4870  DeoR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
288 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.69583 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0515  glycerol-3-phosphate regulon repressor (glp operon repressor)  34.82 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128818  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
254 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 
252 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  34.13 
 
 
252 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1665  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
260 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0473593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.73 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.33 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.73 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.73 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.73 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.73 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.94 
 
 
252 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.54 
 
 
252 aa  141  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4986  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0285298  normal  0.0212972 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3160  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  32.65 
 
 
263 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
252 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  32.65 
 
 
263 aa  135  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  30.2 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.86 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.8 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  35.77 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 
253 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4038  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
275 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  36.33 
 
 
256 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
261 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
277 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 
256 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
258 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.9 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  35.91 
 
 
263 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  30.89 
 
 
269 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.89 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
256 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.79 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.79 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 
267 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
256 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  33.61 
 
 
251 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
251 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 
252 aa  122  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  34 
 
 
263 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
266 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.61 
 
 
251 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  34.8 
 
 
258 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
251 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
245 aa  122  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.09 
 
 
253 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.6 
 
 
314 aa  121  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>