More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0546 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  91.27 
 
 
253 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  90.48 
 
 
253 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  90.51 
 
 
253 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  90.91 
 
 
253 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  90.91 
 
 
604 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  90.91 
 
 
253 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  64.9 
 
 
251 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  66.38 
 
 
252 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  61.74 
 
 
249 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  60.94 
 
 
250 aa  290  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  55.38 
 
 
250 aa  289  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  55.38 
 
 
250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  54.55 
 
 
250 aa  288  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  54.98 
 
 
250 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  54.98 
 
 
252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  66.81 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  54.98 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  54.58 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  54.58 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  54.58 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  54.58 
 
 
252 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  56.4 
 
 
252 aa  281  6.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  54.58 
 
 
252 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  57.77 
 
 
250 aa  281  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
252 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
252 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  54.18 
 
 
252 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  56.43 
 
 
262 aa  278  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  56.43 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
253 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  56.43 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  56.43 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  56.43 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
253 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
253 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  56.43 
 
 
254 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
253 aa  278  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  56.25 
 
 
253 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  56.02 
 
 
254 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  56.12 
 
 
254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  57.64 
 
 
235 aa  271  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  59.92 
 
 
254 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  59.31 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  59.74 
 
 
252 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  57.77 
 
 
250 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  55.34 
 
 
251 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  61.06 
 
 
261 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  43.8 
 
 
312 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.64 
 
 
275 aa  184  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  40.08 
 
 
256 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  43.98 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  40.26 
 
 
289 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  40.5 
 
 
269 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  30.38 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  25.41 
 
 
424 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  29.02 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  32.56 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  32.93 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.04 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  31.78 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  32.35 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  31.52 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  29.19 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  32.21 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.29 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  29.17 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  32.53 
 
 
272 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  28.89 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.18 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  26.48 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.59 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.13 
 
 
289 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  27.27 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.44 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  30.61 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  30.56 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  26.07 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  30.06 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.94 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.69 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.67 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  27.91 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  26.69 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  29.45 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.02 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  26.49 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  31.52 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2687  peptidase M48, Ste24p  28.8 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  26.69 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>