235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3556 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 493 aa  963    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  51.99 
 
 		 496 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  47.98 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  44.69 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  42.89 
 
 		 484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  42.68 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  43.7 
 
 		 487 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  43.93 
 
 		 487 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  43.93 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  42.16 
 
 		 487 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  41.46 
 
 		 464 aa  328  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  43.03 
 
 		 483 aa  323  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  41.65 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  34.36 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  40.64 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  37.8 
 
 		 472 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  35.67 
 
 		 495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  34.47 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 		 456 aa  233  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 		 476 aa  146  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.11 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  32.36 
 
 		 613 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.36 
 
 		 727 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25.85 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 623 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  31.14 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 		 632 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  30.84 
 
 		 627 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 		 503 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  29.79 
 
 		 622 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.75 
 
 		 623 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.34 
 
 		 477 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 		 632 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 		 619 aa  96.7  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 		 623 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.08 
 
 		 480 aa  93.6  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.3 
 
 		 588 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.6 
 
 		 587 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 640 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.62 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  28.99 
 
 		 618 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  31.78 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  24.16 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.02 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.4 
 
 		 623 aa  80.5  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.82 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  26.17 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 		 637 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 		 623 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.58 
 
 		 858 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.05 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.03 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 683 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.03 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  22 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  23 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.85 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  21.56 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  24.87 
 
 		 546 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 		 682 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 		 629 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 		 640 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  20.5 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 		 683 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  21.59 
 
 		 818 aa  70.9  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 		 690 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  24.68 
 
 		 685 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.56 
 
 		 653 aa  69.7  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  20.98 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  25.61 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  23.23 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  25.61 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 		 547 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  24.08 
 
 		 537 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>