163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0558 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  53.74 
 
 		 220 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  51.87 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  46.76 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  37.28 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  128  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  36.32 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  39.23 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.86 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  35.87 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  36.65 
 
 		 220 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  36.49 
 
 		 220 aa  98.2  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  35.43 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  35 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.76 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.08 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.76 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.2 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  35.87 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  35.87 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  35.87 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  33.18 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  36.32 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.6 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  36.32 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  31.62 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  33.18 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  34.62 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  32.18 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  27.9 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  30.71 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  30.71 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  32.88 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  29.37 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.48 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.49 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  32.87 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  32.23 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  26.55 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  36.36 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  32.87 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  34.65 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  28.95 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  27.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  33.06 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.31 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  34.38 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  32.34 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  28.51 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  35.56 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  28.31 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  34.09 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  32.11 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  35.56 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  27.51 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  30.77 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  26.24 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  35.56 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  35.11 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  24.89 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  34.38 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  28.09 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  35.42 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.59 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  25.97 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  31.82 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  31.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  31.55 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  33.71 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  34.48 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  36.96 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  26.67 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  29.86 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  32.98 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  33.72 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32.32 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  35.23 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.23 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  31.31 
 
 		 180 aa  51.6  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  34.09 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>