More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.76 
 
 
303 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  47.3 
 
 
301 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  48.72 
 
 
303 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  50.42 
 
 
292 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
314 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.23 
 
 
319 aa  251  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
298 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
285 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  34.77 
 
 
293 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 
293 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
281 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
283 aa  176  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
284 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
298 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
279 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
296 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
303 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
294 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  32.67 
 
 
329 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
293 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
311 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
297 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
275 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
309 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
279 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
298 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
279 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
279 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
300 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
282 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
278 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
294 aa  156  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
278 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.92 
 
 
278 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
282 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.07 
 
 
277 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
275 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
273 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
280 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.25 
 
 
304 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
284 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
275 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.5 
 
 
277 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  33.47 
 
 
276 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.79 
 
 
295 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
292 aa  152  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
304 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
273 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
274 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  31.27 
 
 
304 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
277 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  30.65 
 
 
285 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
294 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.74 
 
 
278 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
315 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
306 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
288 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
298 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
275 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
278 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
316 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
279 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.77 
 
 
307 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
276 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000118681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.44 
 
 
319 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
297 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  32 
 
 
295 aa  149  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
279 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.9 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 
276 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.67 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  34.44 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
279 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 
279 aa  146  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.41 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  29.87 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.41 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
271 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
290 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
287 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
268 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>